38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0263 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0263  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  50.88 
 
 		 54 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6731  protein of unknown function DUF1328  50 
 
 		 55 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  43.86 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  55.56 
 
 		 56 aa  47.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  45.61 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  51.11 
 
 		 53 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  46.81 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  53.19 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  51.11 
 
 		 53 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  51.11 
 
 		 53 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  51.11 
 
 		 53 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2727  hypothetical protein  45.61 
 
 		 58 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  39.29 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4397  protein of unknown function DUF1328  45.61 
 
 		 58 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522854  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  37.5 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4137  hypothetical protein  58.82 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.320678  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3862  hypothetical protein  35.09 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4171  protein of unknown function DUF1328  35.09 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  44.23 
 
 		 53 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6280  hypothetical protein  57.58 
 
 		 53 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  55.32 
 
 		 53 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4322  protein of unknown function DUF1328  35.09 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72370  hypothetical protein  57.58 
 
 		 53 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.160327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  35.71 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  51.28 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  35.71 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  48.94 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3429  hypothetical protein  48.98 
 
 		 57 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  46.43 
 
 		 54 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  53.19 
 
 		 54 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2772  hypothetical protein  40.74 
 
 		 55 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.773202  normal  0.17509 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  56.76 
 
 		 54 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5876  hypothetical protein  44.9 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2934  hypothetical protein  35.71 
 
 		 57 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0862761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  35.71 
 
 		 57 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  48.72 
 
 		 125 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>