85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5876 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5876  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4322  protein of unknown function DUF1328  82.76 
 
 		 58 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4171  protein of unknown function DUF1328  81.03 
 
 		 58 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3862  hypothetical protein  81.03 
 
 		 58 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2727  hypothetical protein  80.36 
 
 		 58 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4397  protein of unknown function DUF1328  75.86 
 
 		 58 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6383  protein of unknown function DUF1328  96.55 
 
 		 58 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0070  hypothetical protein  84.48 
 
 		 58 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2903  hypothetical protein  85.71 
 
 		 58 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3129  protein of unknown function DUF1328  85.71 
 
 		 58 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.804441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  69.09 
 
 		 57 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5006  hypothetical protein  85.71 
 
 		 58 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0555285  normal  0.110009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  67.27 
 
 		 57 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  70.18 
 
 		 57 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3027  protein of unknown function DUF1328  83.93 
 
 		 58 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.171842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  60 
 
 		 57 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  60 
 
 		 57 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  60 
 
 		 57 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0484  hypothetical protein  62.5 
 
 		 56 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0245  protein of unknown function DUF1328  61.22 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6140  hypothetical protein  67.27 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0548604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  56.9 
 
 		 54 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  64.81 
 
 		 53 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  64.81 
 
 		 53 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  64.81 
 
 		 53 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  64.81 
 
 		 53 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  62.96 
 
 		 54 aa  57  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  63.27 
 
 		 53 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4020  hypothetical protein  65.45 
 
 		 57 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436105  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  56.36 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  64.44 
 
 		 56 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0536  hypothetical protein  65.38 
 
 		 53 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217472  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0654  hypothetical protein  63.46 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.450723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  53.7 
 
 		 54 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  59.18 
 
 		 52 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  52.83 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4137  hypothetical protein  55.17 
 
 		 58 aa  52  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.320678  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0270  hypothetical protein  56.9 
 
 		 54 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575261 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0835  hypothetical protein  57.69 
 
 		 53 aa  51.6  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  50 
 
 		 55 aa  50.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  50 
 
 		 54 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0879  hypothetical protein  48.15 
 
 		 54 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.60509  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  55.77 
 
 		 54 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2131  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  48.08 
 
 		 54 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6731  protein of unknown function DUF1328  55.56 
 
 		 55 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1875  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  50 
 
 		 53 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  48.15 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2834  hypothetical protein  51.92 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.397287  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3511  hypothetical protein  51.92 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0920  hypothetical protein  56.86 
 
 		 54 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0482  hypothetical protein  55.36 
 
 		 56 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0991  hypothetical protein  53.06 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0179922  hitchhiker  0.000000000000845091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3864  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.231517  normal  0.991686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2406  hypothetical protein  60 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1447  hypothetical protein  55.17 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2772  hypothetical protein  50 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.773202  normal  0.17509 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  46.15 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2901  hypothetical protein  56.9 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3474  protein of unknown function DUF1328  42.86 
 
 		 54 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72370  hypothetical protein  69.7 
 
 		 53 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.160327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6280  hypothetical protein  69.7 
 
 		 53 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  43.5  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3712  hypothetical protein  56.14 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4110  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2933  hypothetical protein  51.72 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.37502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1421  hypothetical protein  51.72 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1413  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1322  hypothetical protein  50.88 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2202  hypothetical protein  54.55 
 
 		 51 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01267  hypothetical protein  54.39 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.106707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2671  hypothetical protein  49.12 
 
 		 75 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1861  protein of unknown function DUF1328  42.86 
 
 		 54 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0562518  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  41.51 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2739  hypothetical protein  49.12 
 
 		 58 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01748  hypothetical protein  56.52 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0263  hypothetical protein  44.9 
 
 		 59 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0112  hypothetical protein  46.43 
 
 		 57 aa  40.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0139  hypothetical protein  51.11 
 
 		 51 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0130  hypothetical protein  51.11 
 
 		 51 aa  40.8  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  41.82 
 
 		 57 aa  40  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>