58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1875 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1875  hypothetical protein  100 
 
 		 54 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4110  hypothetical protein  74.07 
 
 		 54 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0879  hypothetical protein  75.93 
 
 		 54 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.60509  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  71.7 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0920  hypothetical protein  72.22 
 
 		 54 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  61.11 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3864  hypothetical protein  73.58 
 
 		 54 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.231517  normal  0.991686 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3511  hypothetical protein  71.7 
 
 		 54 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2834  hypothetical protein  71.7 
 
 		 54 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.397287  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  64.81 
 
 		 54 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2238  hypothetical protein  61.11 
 
 		 55 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  59.26 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2904  hypothetical protein  83.02 
 
 		 54 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  52.83 
 
 		 53 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  61.22 
 
 		 53 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  61.22 
 
 		 53 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  61.22 
 
 		 53 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  61.22 
 
 		 53 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  49.06 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  57.14 
 
 		 54 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  66.67 
 
 		 52 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  59.26 
 
 		 51 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  52.83 
 
 		 55 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  57.69 
 
 		 53 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  50.94 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  57.14 
 
 		 52 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  55.1 
 
 		 54 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4397  protein of unknown function DUF1328  53.7 
 
 		 58 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2727  hypothetical protein  53.7 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0473  protein of unknown function DUF1328  72.22 
 
 		 54 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0245  protein of unknown function DUF1328  50.94 
 
 		 57 aa  50.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  52.83 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0947  hypothetical protein  62.96 
 
 		 55 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.633529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1091  hypothetical protein  62.96 
 
 		 55 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5876  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  47.17 
 
 		 54 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3474  protein of unknown function DUF1328  53.06 
 
 		 54 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  65.79 
 
 		 56 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  48.15 
 
 		 57 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  45.28 
 
 		 56 aa  47.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0270  hypothetical protein  57.14 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575261 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  50.94 
 
 		 54 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  50.94 
 
 		 54 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  56.1 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  44.44 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3862  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4171  protein of unknown function DUF1328  50 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  48.15 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4322  protein of unknown function DUF1328  48.15 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  42.59 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  42.59 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  40.38 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  48 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2239  hypothetical protein  59.46 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02225  hypothetical protein  64.81 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0991  hypothetical protein  46.15 
 
 		 52 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0179922  hitchhiker  0.000000000000845091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6731  protein of unknown function DUF1328  49.02 
 
 		 55 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0341  hypothetical protein  47.17 
 
 		 54 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638525  normal  0.209379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>