36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0991 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0991  hypothetical protein  100 
 
 
52 aa  94.7  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0179922  hitchhiker  0.000000000000845091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0654  hypothetical protein  55.77 
 
 
85 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.450723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0536  hypothetical protein  51.92 
 
 
53 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217472  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0835  hypothetical protein  51.92 
 
 
53 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  55.56 
 
 
56 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  53.85 
 
 
54 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  46.15 
 
 
53 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  52.94 
 
 
54 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3474  protein of unknown function DUF1328  44.23 
 
 
54 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  49.02 
 
 
52 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2772  hypothetical protein  42.31 
 
 
55 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.773202  normal  0.17509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  50 
 
 
53 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  50 
 
 
53 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  50 
 
 
53 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  50 
 
 
53 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5876  hypothetical protein  53.06 
 
 
58 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  49.06 
 
 
57 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0130  hypothetical protein  50 
 
 
51 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0139  hypothetical protein  50.98 
 
 
51 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0484  hypothetical protein  49.02 
 
 
56 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  50 
 
 
58 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3631  hypothetical protein  53.85 
 
 
53 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3502  hypothetical protein  53.85 
 
 
53 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3862  hypothetical protein  48.98 
 
 
58 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4171  protein of unknown function DUF1328  48.98 
 
 
58 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4322  protein of unknown function DUF1328  48.98 
 
 
58 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122476  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2202  hypothetical protein  50 
 
 
51 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6731  protein of unknown function DUF1328  46.3 
 
 
55 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349248  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2727  hypothetical protein  48.98 
 
 
58 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4397  protein of unknown function DUF1328  46.94 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522854  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1875  hypothetical protein  46.15 
 
 
54 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3464  protein of unknown function DUF1328  44.23 
 
 
53 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  44.68 
 
 
57 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  45.28 
 
 
55 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  42.86 
 
 
57 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0245  protein of unknown function DUF1328  48.94 
 
 
57 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0548817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>