64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3474 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3474  protein of unknown function DUF1328  100 
 
 		 54 aa  102  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  62.96 
 
 		 54 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  64.81 
 
 		 56 aa  63.5  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  64.71 
 
 		 52 aa  57.4  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  64 
 
 		 52 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1861  protein of unknown function DUF1328  63.46 
 
 		 54 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0562518  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  58.82 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  62 
 
 		 51 aa  57  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2772  hypothetical protein  51.92 
 
 		 55 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.773202  normal  0.17509 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0270  hypothetical protein  51.92 
 
 		 54 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  61.22 
 
 		 55 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2500  protein of unknown function DUF1328  68.63 
 
 		 52 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  58 
 
 		 53 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  58 
 
 		 53 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  58 
 
 		 53 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  58 
 
 		 53 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  49.06 
 
 		 53 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  51.85 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2238  hypothetical protein  55.56 
 
 		 55 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0654  hypothetical protein  47.06 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.450723 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0835  hypothetical protein  50.98 
 
 		 53 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0991  hypothetical protein  44.23 
 
 		 52 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0179922  hitchhiker  0.000000000000845091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0248  hypothetical protein  55.77 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  54.35 
 
 		 54 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0536  hypothetical protein  45.1 
 
 		 53 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217472  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1875  hypothetical protein  53.06 
 
 		 54 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  54.35 
 
 		 54 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  44.9 
 
 		 58 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  51.85 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  47.37 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0484  hypothetical protein  54.9 
 
 		 56 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  47.37 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  44.9 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4171  protein of unknown function DUF1328  48.21 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3862  hypothetical protein  48.21 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  45.61 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4322  protein of unknown function DUF1328  48.21 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  54.17 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  43.86 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  43.86 
 
 		 57 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  46.94 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  51.02 
 
 		 57 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5876  hypothetical protein  42.86 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  42.55 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4110  hypothetical protein  44.9 
 
 		 54 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4397  protein of unknown function DUF1328  46.43 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2727  hypothetical protein  43.1 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2131  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3429  hypothetical protein  46.3 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  44.9 
 
 		 54 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3864  hypothetical protein  48.89 
 
 		 54 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.231517  normal  0.991686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0879  hypothetical protein  42.86 
 
 		 54 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.60509  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3511  hypothetical protein  46.67 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  45.83 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2834  hypothetical protein  46.67 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.397287  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  44.68 
 
 		 72 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4137  hypothetical protein  62.5 
 
 		 58 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.320678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0177  protein of unknown function DUF1328  47.73 
 
 		 57 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405777  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1091  hypothetical protein  48.98 
 
 		 55 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  42.86 
 
 		 53 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0947  hypothetical protein  48.98 
 
 		 55 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.633529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  45.28 
 
 		 57 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0341  hypothetical protein  59.18 
 
 		 54 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638525  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4020  hypothetical protein  45.61 
 
 		 57 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>