54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0248 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0248  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  154  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  58.93 
 
 		 56 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  57.69 
 
 		 54 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3474  protein of unknown function DUF1328  55.77 
 
 		 54 aa  60.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  69.57 
 
 		 54 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  69.57 
 
 		 54 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  60.78 
 
 		 52 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  65.31 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2772  hypothetical protein  52.83 
 
 		 55 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.773202  normal  0.17509 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0654  hypothetical protein  45.28 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.450723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  53.7 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0536  hypothetical protein  49.06 
 
 		 53 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217472  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  58 
 
 		 53 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  58 
 
 		 53 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  58 
 
 		 53 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  58 
 
 		 53 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  50 
 
 		 53 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  52.94 
 
 		 54 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  56.25 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  56.25 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2500  protein of unknown function DUF1328  62.75 
 
 		 52 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0270  hypothetical protein  46.3 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575261 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0835  hypothetical protein  47.06 
 
 		 53 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1861  protein of unknown function DUF1328  48.15 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0562518  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  51.02 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  55.1 
 
 		 53 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  51.02 
 
 		 57 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  53.06 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  46.43 
 
 		 56 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6731  protein of unknown function DUF1328  53.19 
 
 		 55 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0991  hypothetical protein  40.38 
 
 		 52 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0179922  hitchhiker  0.000000000000845091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  46.94 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  46.94 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  47.27 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  42.86 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5876  hypothetical protein  44.83 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  48 
 
 		 51 aa  42.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3429  hypothetical protein  44.44 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2510  hypothetical protein  46 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0937034  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  37.68 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0341  hypothetical protein  67.35 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638525  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3001  hypothetical protein  44.44 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  47.83 
 
 		 52 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2934  hypothetical protein  42 
 
 		 57 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0862761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2238  hypothetical protein  44.44 
 
 		 55 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0484  hypothetical protein  44.64 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  49.06 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0263  hypothetical protein  47.62 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4171  protein of unknown function DUF1328  42.86 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3862  hypothetical protein  42.86 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4110  hypothetical protein  42.86 
 
 		 54 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4322  protein of unknown function DUF1328  42.86 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  45.61 
 
 		 57 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>