41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3821 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3821  protein of unknown function DUF1328  100 
 
 		 57 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3429  hypothetical protein  68.42 
 
 		 57 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  62.26 
 
 		 57 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3728  hypothetical protein  69.64 
 
 		 57 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2934  hypothetical protein  61.22 
 
 		 57 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0862761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2510  hypothetical protein  59.18 
 
 		 57 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0937034  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2239  hypothetical protein  70.27 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3001  hypothetical protein  51.79 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0177  protein of unknown function DUF1328  49.12 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405777  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1842  hypothetical protein  47.06 
 
 		 53 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000526578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5399  hypothetical protein  61.11 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2356  hypothetical protein  63.89 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3438  hypothetical protein  68.75 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.975821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  49.02 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3661  hypothetical protein  68.57 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  hitchhiker  0.004318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2727  hypothetical protein  42.59 
 
 		 58 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4397  protein of unknown function DUF1328  40.74 
 
 		 58 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522854  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  47.06 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  48.65 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3354  protein of unknown function DUF1328  40.35 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  40.74 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3759  hypothetical protein  40.35 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102479 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  40.74 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  47.17 
 
 		 72 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  37.04 
 
 		 57 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  45.1 
 
 		 54 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  38.89 
 
 		 57 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  38.89 
 
 		 57 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2238  hypothetical protein  43.4 
 
 		 55 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  46.94 
 
 		 56 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  38.89 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0879  hypothetical protein  48.65 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.60509  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0056  hypothetical protein  45.1 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  38.89 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3158  hypothetical protein  54.29 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  48.65 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3482  protein of unknown function DUF1328  54.29 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.740608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  45.83 
 
 		 54 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  46 
 
 		 55 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3864  hypothetical protein  48.65 
 
 		 54 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.231517  normal  0.991686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  39.22 
 
 		 57 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>