43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3661 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3661  hypothetical protein  100 
 
 
57 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  hitchhiker  0.004318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0177  protein of unknown function DUF1328  89.47 
 
 
57 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3759  hypothetical protein  70.18 
 
 
59 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.102479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3354  protein of unknown function DUF1328  73.68 
 
 
59 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46213  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3429  hypothetical protein  56.14 
 
 
57 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3158  hypothetical protein  71.93 
 
 
59 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176198  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3482  protein of unknown function DUF1328  71.93 
 
 
59 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.740608  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  53.57 
 
 
57 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3728  hypothetical protein  51.79 
 
 
57 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2239  hypothetical protein  68.57 
 
 
57 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2934  hypothetical protein  45.45 
 
 
57 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0862761  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2510  hypothetical protein  44.23 
 
 
57 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0937034  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3821  protein of unknown function DUF1328  49.12 
 
 
57 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  51.02 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2238  hypothetical protein  46.3 
 
 
55 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  54.55 
 
 
52 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0124  hypothetical protein  52.08 
 
 
54 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5399  hypothetical protein  62.86 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577848  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0032  hypothetical protein  66.04 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.637733  normal  0.748196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2356  hypothetical protein  60 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01748  hypothetical protein  42.86 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  54.55 
 
 
55 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2080  hypothetical protein  44 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0093  hypothetical protein  54.17 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3001  hypothetical protein  41.07 
 
 
58 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0978  hypothetical protein  67.35 
 
 
61 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.568203  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  53.19 
 
 
53 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  44.68 
 
 
58 aa  43.9  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0703  hypothetical protein  65.62 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.07802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0681  hypothetical protein  65.62 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3474  protein of unknown function DUF1328  47.73 
 
 
54 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2834  hypothetical protein  48.98 
 
 
54 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.397287  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  50.91 
 
 
54 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3511  hypothetical protein  48.98 
 
 
54 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3864  hypothetical protein  46.94 
 
 
54 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.231517  normal  0.991686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03948  hypothetical protein  47.73 
 
 
52 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  39.29 
 
 
57 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0172  hypothetical protein  50 
 
 
51 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  50 
 
 
54 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3438  hypothetical protein  57.58 
 
 
57 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.975821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0920  hypothetical protein  44.9 
 
 
54 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  40.74 
 
 
54 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  45.83 
 
 
72 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>