136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0047 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  100 
 
 
119 aa  245  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  48.7 
 
 
115 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  46.09 
 
 
114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  44.35 
 
 
114 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0766  hypothetical protein  44.35 
 
 
114 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.877225  normal  0.182245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  45.22 
 
 
113 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6100  protein of unknown function DUF861 cupin_3  43.48 
 
 
114 aa  103  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  0.927165 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6574  protein of unknown function DUF861 cupin_3  44.35 
 
 
114 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.647379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  43.48 
 
 
113 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1483  hypothetical protein  41.74 
 
 
114 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171215  hitchhiker  0.000969806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  43.48 
 
 
113 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  42.61 
 
 
113 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  42.24 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  44.79 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  37.35 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.35 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.35 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.35 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.35 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.35 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.35 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.35 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.35 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.35 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.95 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  36.14 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.46 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.53 
 
 
227 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.47 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3784  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.94 
 
 
222 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.91 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.71 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  33.73 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  33.73 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.39 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.84 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.53 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.28 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42.03 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  32.1 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  32.53 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  34.18 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.94 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.29 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.29 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  32.94 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.94 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.94 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  36.99 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  31.25 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  32.89 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.1 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.76 
 
 
117 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.1 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.08 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  31.65 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  31.08 
 
 
124 aa  50.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.86 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.43 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.89 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.21 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.76 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.62 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.1 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  31.17 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  32.81 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  31.25 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.29 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.23 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  32.81 
 
 
91 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.82 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  31.25 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.89 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.59 
 
 
121 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5714  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.44 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.89 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.88 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  30 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  30.26 
 
 
121 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  31.65 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  31.25 
 
 
91 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  30.49 
 
 
91 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.38 
 
 
120 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  31.08 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.4 
 
 
150 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.11 
 
 
244 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.43 
 
 
127 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1940  protein of the cupin superfamily-like protein  33.77 
 
 
131 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.77 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  37.31 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  32.81 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1755  hypothetical protein  32.84 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.84 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.78 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0401  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.84 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6271  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.77 
 
 
244 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  32.35 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5000  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.72 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883571  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.81 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1650  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.17 
 
 
239 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.350548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>