More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0055 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6594  aldehyde dehydrogenase  68.36 
 
 
492 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.596939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0055  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
498 aa  1003    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.103268  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1492  aldehyde dehydrogenase  68.02 
 
 
492 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3077  aldehyde dehydrogenase  60.53 
 
 
500 aa  604  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364593  normal  0.0549958 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0773  betaine-aldehyde dehydrogenase  58.25 
 
 
518 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.781579  normal  0.7194 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2938  aldehyde dehydrogenase  60.28 
 
 
490 aa  564  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5026  Betaine-aldehyde dehydrogenase  57.4 
 
 
487 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2908  Aldehyde Dehydrogenase  59.96 
 
 
487 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.491333  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5673  aldehyde dehydrogenase  57.05 
 
 
476 aa  524  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5602  aldehyde dehydrogenase  56.39 
 
 
487 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1545  Aldehyde Dehydrogenase  55.51 
 
 
487 aa  505  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678495  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4971  aldehyde dehydrogenase  56.19 
 
 
487 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3527  aldehyde dehydrogenase  40.85 
 
 
495 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000694209  normal  0.0931426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2123  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.77 
 
 
496 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5330  aldehyde dehydrogenase  40.37 
 
 
497 aa  359  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0557529 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.98 
 
 
495 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5188  aldehyde dehydrogenase  40.37 
 
 
526 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.536573  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5278  aldehyde dehydrogenase family protein  40.16 
 
 
497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.25 
 
 
495 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.82 
 
 
495 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1822  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.57 
 
 
495 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0935717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0092  aldehyde dehydrogenase family protein  41.75 
 
 
497 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.769215  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0227  aldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 
499 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01277  gamma-Glu-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, NAD(P)H-dependent  40.2 
 
 
495 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2346  Aldehyde Dehydrogenase  40.2 
 
 
495 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952724  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01288  hypothetical protein  40.2 
 
 
495 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1415  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.2 
 
 
495 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.37 
 
 
495 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2648  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
498 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868356  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  41.98 
 
 
495 aa  351  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1536  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.2 
 
 
495 aa  350  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0192  aldehyde dehydrogenase  39.43 
 
 
497 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000810218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0937  aldehyde dehydrogenase  38.72 
 
 
499 aa  349  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370684  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0967  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
498 aa  349  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.593803  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70140  putative aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
497 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643605  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6087  putative aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
497 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  40.24 
 
 
506 aa  347  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3105  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.04 
 
 
498 aa  347  3e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791112  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  41.16 
 
 
499 aa  347  4e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5534  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.29 
 
 
497 aa  346  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4669  Aldehyde Dehydrogenase  42.77 
 
 
497 aa  346  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395716  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3034  aldehyde dehydrogenase  38.84 
 
 
499 aa  345  8e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.329193  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1187  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.83 
 
 
509 aa  345  8.999999999999999e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0237  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.86 
 
 
497 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0945  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.94 
 
 
497 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587312  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3021  aldehyde dehydrogenase  38.36 
 
 
498 aa  343  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1623  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.36 
 
 
499 aa  343  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207083  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2926  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.83 
 
 
498 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7675  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.56 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3008  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.62 
 
 
498 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.227807  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2065  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 
498 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1737  aldehyde dehydrogenase  41.25 
 
 
498 aa  338  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000892172 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1085  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
498 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000455021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3202  Aldehyde Dehydrogenase  38.22 
 
 
498 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.394681 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0734  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.72 
 
 
528 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2026  aldehyde dehydrogenase family protein  43.72 
 
 
496 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0642  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.72 
 
 
496 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3496  aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 
498 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1045  aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  37.14 
 
 
503 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.154048  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1093  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
498 aa  336  7e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0180881  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1187  aldehyde dehydrogenase  37.81 
 
 
498 aa  336  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1153  aldehyde dehydrogenase  37.81 
 
 
498 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734271  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4003  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
498 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.71 
 
 
498 aa  333  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1115  aldehyde dehydrogenase  38.36 
 
 
502 aa  333  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00211349  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1869  aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 
496 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3567  aldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 
497 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1942  aldehyde dehydrogenase family protein  42.35 
 
 
496 aa  332  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6073  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.1 
 
 
496 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.972484  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3859  aldehyde dehydrogenase  40.66 
 
 
497 aa  332  9e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3127  aldehyde dehydrogenase  40.91 
 
 
497 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 
490 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2836  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
495 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123667  normal  0.548421 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  41.16 
 
 
497 aa  330  3e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.79 
 
 
488 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.79 
 
 
488 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.37 
 
 
488 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2990  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
496 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3010  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
496 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2376  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
496 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2589  aldehyde dehydrogenase family protein  40.91 
 
 
497 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  41.42 
 
 
488 aa  329  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.26 
 
 
479 aa  329  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3249  aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
497 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0656585 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3176  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.42 
 
 
495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.762089  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  39.84 
 
 
497 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2725  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 
493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2545  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.49 
 
 
511 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572579 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3533  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.42 
 
 
495 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6339  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.77 
 
 
496 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  41.42 
 
 
479 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4933  aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
497 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
495 aa  325  2e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
488 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  40.96 
 
 
488 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2872  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
496 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.442211  normal  0.721273 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2174  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 
479 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019217 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3037  aldehyde dehydrogenase  43.19 
 
 
496 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1741  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.83 
 
 
504 aa  322  8e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0495652  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>