More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1115 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5330  aldehyde dehydrogenase  70.94 
 
 		 497 aa  738    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5278  aldehyde dehydrogenase family protein  70.94 
 
 		 497 aa  739    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1115  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 502 aa  1032    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00211349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70140  putative aldehyde dehydrogenase  71.94 
 
 		 497 aa  736    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643605  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3496  aldehyde dehydrogenase  80.64 
 
 		 498 aa  834    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0092  aldehyde dehydrogenase family protein  71.74 
 
 		 497 aa  744    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.769215  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1085  aldehyde dehydrogenase  81.44 
 
 		 498 aa  839    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000455021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6087  putative aldehyde dehydrogenase  71.94 
 
 		 497 aa  737    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0227  aldehyde dehydrogenase  72.75 
 
 		 499 aa  749    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0967  aldehyde dehydrogenase  85.03 
 
 		 498 aa  873    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.593803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1093  aldehyde dehydrogenase  81.84 
 
 		 498 aa  843    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0180881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2123  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  68.21 
 
 		 496 aa  719    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5534  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  71.14 
 
 		 497 aa  732    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5188  aldehyde dehydrogenase  70.74 
 
 		 526 aa  736    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.536573  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1187  aldehyde dehydrogenase  82.04 
 
 		 498 aa  846    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1153  aldehyde dehydrogenase  82.04 
 
 		 498 aa  847    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2648  aldehyde dehydrogenase  80.24 
 
 		 498 aa  820    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3034  aldehyde dehydrogenase  80.48 
 
 		 499 aa  834    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.329193  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1045  aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  87.28 
 
 		 503 aa  900    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.154048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0937  aldehyde dehydrogenase  81.67 
 
 		 499 aa  844    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0237  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  72.14 
 
 		 497 aa  741    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3105  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  80.84 
 
 		 498 aa  835    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3202  Aldehyde Dehydrogenase  81.64 
 
 		 498 aa  842    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.394681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48030  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  70.26 
 
 		 497 aa  703    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2926  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  80.44 
 
 		 498 aa  833    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3008  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  80.84 
 
 		 498 aa  838    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.227807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3021  aldehyde dehydrogenase  81.64 
 
 		 498 aa  841    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0192  aldehyde dehydrogenase  70.34 
 
 		 497 aa  729    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810218 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  60.08 
 
 		 495 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0945  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  61.05 
 
 		 497 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4669  Aldehyde Dehydrogenase  61.26 
 
 		 497 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1737  aldehyde dehydrogenase  56.37 
 
 		 498 aa  580  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000892172 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3567  aldehyde dehydrogenase  59.84 
 
 		 497 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2065  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  54.34 
 
 		 498 aa  575  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1942  aldehyde dehydrogenase family protein  59.64 
 
 		 496 aa  571  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0049  betaine-aldehyde dehydrogenase  57.05 
 
 		 505 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  54.97 
 
 		 495 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1822  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  55.17 
 
 		 495 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935717 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1330  Aldehyde Dehydrogenase  58.48 
 
 		 498 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174379  normal  0.217301 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01277  gamma-Glu-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, NAD(P)H-dependent  54.77 
 
 		 495 aa  561  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2346  Aldehyde Dehydrogenase  54.77 
 
 		 495 aa  561  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952724  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0642  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  59.04 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2026  aldehyde dehydrogenase family protein  59.04 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0356  aldehyde dehydrogenase  59.54 
 
 		 489 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.69961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01288  hypothetical protein  54.77 
 
 		 495 aa  561  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1415  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  54.77 
 
 		 495 aa  561  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2545  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  55.8 
 
 		 511 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572579 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0734  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  59.04 
 
 		 528 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  54.56 
 
 		 495 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  54.56 
 
 		 495 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3859  aldehyde dehydrogenase  55.78 
 
 		 497 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1536  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  54.56 
 
 		 495 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2836  aldehyde dehydrogenase  56.33 
 
 		 495 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123667  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3176  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.12 
 
 		 495 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3010  aldehyde dehydrogenase  60.93 
 
 		 496 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3533  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  55.91 
 
 		 495 aa  554  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185726  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3527  aldehyde dehydrogenase  54.34 
 
 		 495 aa  554  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000694209  normal  0.0931426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1909  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56.88 
 
 		 499 aa  553  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.295691 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1187  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.98 
 
 		 509 aa  554  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7675  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  57.85 
 
 		 496 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6339  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  60.53 
 
 		 496 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2990  aldehyde dehydrogenase  60.93 
 
 		 496 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2376  aldehyde dehydrogenase  60.93 
 
 		 496 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4933  aldehyde dehydrogenase  51.93 
 
 		 497 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1623  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.98 
 
 		 499 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2984  aldehyde dehydrogenase  60.93 
 
 		 496 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2725  aldehyde dehydrogenase  52.61 
 
 		 493 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0298  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  57.14 
 
 		 499 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2589  aldehyde dehydrogenase family protein  51.83 
 
 		 497 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  51.41 
 
 		 499 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3249  aldehyde dehydrogenase  51.42 
 
 		 497 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0656585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3127  aldehyde dehydrogenase  51.22 
 
 		 497 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2900  aldehyde dehydrogenase  60.12 
 
 		 496 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6073  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.09 
 
 		 496 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.972484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3037  aldehyde dehydrogenase  59.92 
 
 		 496 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0305  putative aldehyde dehydrogenase  51.72 
 
 		 496 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2872  aldehyde dehydrogenase  49.49 
 
 		 496 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.442211  normal  0.721273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02680  putative aldehyde dehydrogenase  51.93 
 
 		 496 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.24739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1741  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.74 
 
 		 504 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  54.2 
 
 		 495 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0566  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.3 
 
 		 504 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6645  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.7 
 
 		 501 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217332  normal  0.0894525 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4432  Aldehyde Dehydrogenase  50.53 
 
 		 492 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31630  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  47.75 
 
 		 491 aa  475  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6864  aldehyde dehydrogenase  47.29 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0403228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4003  aldehyde dehydrogenase  48.01 
 
 		 498 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1869  aldehyde dehydrogenase  51.36 
 
 		 496 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1074  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 		 492 aa  472  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.178667  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1171  aldehyde dehydrogenase family protein  48.42 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2110  aldehyde dehydrogenase  47.37 
 
 		 502 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0052069  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  45.44 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1371  aldehyde dehydrogenase  47.68 
 
 		 500 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0762191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4109  aldehyde dehydrogenase  45.93 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1689  Aldehyde Dehydrogenase  46.23 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.337297  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.4 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5756  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.9 
 
 		 497 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  44.2 
 
 		 505 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3507  aldehyde dehydrogenase  47.26 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.190202  decreased coverage  0.0000753817 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7257  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  47.9 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>