More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0967 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1093  aldehyde dehydrogenase  83.33 
 
 		 498 aa  851    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0180881  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2648  aldehyde dehydrogenase  83.73 
 
 		 498 aa  850    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6087  putative aldehyde dehydrogenase  73.19 
 
 		 497 aa  745    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5278  aldehyde dehydrogenase family protein  72.78 
 
 		 497 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3496  aldehyde dehydrogenase  83.13 
 
 		 498 aa  856    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0092  aldehyde dehydrogenase family protein  72.98 
 
 		 497 aa  745    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.769215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48030  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  73.09 
 
 		 497 aa  720    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1115  aldehyde dehydrogenase  85.03 
 
 		 502 aa  874    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00211349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70140  putative aldehyde dehydrogenase  73.19 
 
 		 497 aa  745    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0937  aldehyde dehydrogenase  83.33 
 
 		 499 aa  856    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0227  aldehyde dehydrogenase  73.59 
 
 		 499 aa  751    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2123  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  68.97 
 
 		 496 aa  712    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5534  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  71.98 
 
 		 497 aa  736    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5188  aldehyde dehydrogenase  72.78 
 
 		 526 aa  747    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.536573  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0192  aldehyde dehydrogenase  72.38 
 
 		 497 aa  740    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5330  aldehyde dehydrogenase  72.98 
 
 		 497 aa  749    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3202  Aldehyde Dehydrogenase  83.33 
 
 		 498 aa  851    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.394681 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1085  aldehyde dehydrogenase  83.53 
 
 		 498 aa  850    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000455021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1187  aldehyde dehydrogenase  83.53 
 
 		 498 aa  853    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1153  aldehyde dehydrogenase  83.33 
 
 		 498 aa  850    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734271  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1045  aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  83.86 
 
 		 503 aa  866    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.154048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3034  aldehyde dehydrogenase  82.93 
 
 		 499 aa  846    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.329193  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3105  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  83.33 
 
 		 498 aa  853    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0967  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 498 aa  1025    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.593803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0237  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  72.58 
 
 		 497 aa  741    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2926  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  83.33 
 
 		 498 aa  854    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3008  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  82.93 
 
 		 498 aa  852    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.227807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3021  aldehyde dehydrogenase  84.94 
 
 		 498 aa  870    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  60.85 
 
 		 495 aa  628  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2065  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.93 
 
 		 498 aa  599  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1822  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.26 
 
 		 495 aa  592  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1415  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.65 
 
 		 495 aa  589  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01277  gamma-Glu-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, NAD(P)H-dependent  56.65 
 
 		 495 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2346  Aldehyde Dehydrogenase  56.65 
 
 		 495 aa  589  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.65 
 
 		 495 aa  590  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.06 
 
 		 495 aa  588  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01288  hypothetical protein  56.65 
 
 		 495 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.24 
 
 		 495 aa  585  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1536  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.24 
 
 		 495 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1330  Aldehyde Dehydrogenase  61.04 
 
 		 498 aa  581  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174379  normal  0.217301 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0945  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  60 
 
 		 497 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1737  aldehyde dehydrogenase  55.22 
 
 		 498 aa  574  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000892172 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4669  Aldehyde Dehydrogenase  60.61 
 
 		 497 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0356  aldehyde dehydrogenase  61.04 
 
 		 489 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.69961  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3567  aldehyde dehydrogenase  59.18 
 
 		 497 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1942  aldehyde dehydrogenase family protein  60 
 
 		 496 aa  567  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3859  aldehyde dehydrogenase  56.16 
 
 		 497 aa  561  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1187  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.98 
 
 		 509 aa  560  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0642  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  59.27 
 
 		 496 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0734  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  59.27 
 
 		 528 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2026  aldehyde dehydrogenase family protein  59.27 
 
 		 496 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4933  aldehyde dehydrogenase  54.19 
 
 		 497 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0049  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.97 
 
 		 505 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2990  aldehyde dehydrogenase  61.3 
 
 		 496 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3527  aldehyde dehydrogenase  53.94 
 
 		 495 aa  555  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000694209  normal  0.0931426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3010  aldehyde dehydrogenase  61.3 
 
 		 496 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0298  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  57.76 
 
 		 499 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2545  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  55.53 
 
 		 511 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1623  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56.22 
 
 		 499 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2376  aldehyde dehydrogenase  61.3 
 
 		 496 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6073  betaine-aldehyde dehydrogenase  58.35 
 
 		 496 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.972484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6339  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  60.9 
 
 		 496 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3176  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.69 
 
 		 495 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7675  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  58.42 
 
 		 496 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2836  aldehyde dehydrogenase  53.69 
 
 		 495 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123667  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2984  aldehyde dehydrogenase  61.3 
 
 		 496 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3533  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.48 
 
 		 495 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185726  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3249  aldehyde dehydrogenase  52.34 
 
 		 497 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0656585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2589  aldehyde dehydrogenase family protein  52.55 
 
 		 497 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1909  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  55.01 
 
 		 499 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.295691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3127  aldehyde dehydrogenase  52.14 
 
 		 497 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3037  aldehyde dehydrogenase  61.1 
 
 		 496 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2900  aldehyde dehydrogenase  60.9 
 
 		 496 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2725  aldehyde dehydrogenase  53.12 
 
 		 493 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  51.93 
 
 		 499 aa  534  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2872  aldehyde dehydrogenase  50.4 
 
 		 496 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.442211  normal  0.721273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0305  putative aldehyde dehydrogenase  52.15 
 
 		 496 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02680  putative aldehyde dehydrogenase  52.35 
 
 		 496 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.24739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0566  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  52.22 
 
 		 504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  53 
 
 		 495 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1741  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.58 
 
 		 504 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6645  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.1 
 
 		 501 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217332  normal  0.0894525 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4432  Aldehyde Dehydrogenase  50.53 
 
 		 492 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1869  aldehyde dehydrogenase  51.61 
 
 		 496 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6864  aldehyde dehydrogenase  47.36 
 
 		 497 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0403228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31630  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  48.34 
 
 		 491 aa  478  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1074  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 		 492 aa  478  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.178667  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1171  aldehyde dehydrogenase family protein  49.26 
 
 		 492 aa  475  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4003  aldehyde dehydrogenase  47.56 
 
 		 498 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5756  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.18 
 
 		 497 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1371  aldehyde dehydrogenase  47.47 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0762191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4109  aldehyde dehydrogenase  46.08 
 
 		 496 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3507  aldehyde dehydrogenase  48.63 
 
 		 494 aa  461  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.190202  decreased coverage  0.0000753817 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2110  aldehyde dehydrogenase  45.4 
 
 		 502 aa  455  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0052069  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1689  Aldehyde Dehydrogenase  45.6 
 
 		 500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.337297  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.27 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  44.9 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7257  aldehyde dehydrogenase  43.86 
 
 		 505 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  46.33 
 
 		 490 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  42.86 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>