15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0029 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0029  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0017  hypothetical protein  67.98 
 
 
189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0011  hypothetical protein  50.85 
 
 
181 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00169291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0015  protein of unknown function DUF1520  46.25 
 
 
192 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0023  hypothetical protein  50.41 
 
 
184 aa  99  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0025  protein of unknown function DUF1520  47.2 
 
 
209 aa  96.3  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0007  hypothetical protein  47.2 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.906518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0024  hypothetical protein  52.68 
 
 
187 aa  95.5  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4985  hypothetical protein  39.52 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1386  hypothetical protein  38.17 
 
 
267 aa  54.7  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000111197  normal  0.104164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1246  hypothetical protein  39.13 
 
 
179 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188378  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5729  hypothetical protein  30.63 
 
 
182 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.687337  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  29.06 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  30.77 
 
 
280 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1812  hypothetical protein  28.97 
 
 
192 aa  41.2  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.731623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>