68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0008 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0008  NnrU  100 
 
 
192 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0055  hypothetical protein  70.83 
 
 
192 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.402029  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0006  NnrU  65.62 
 
 
192 aa  235  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23902  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4856  NnrU family protein  59.38 
 
 
192 aa  227  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486506  normal  0.0137655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4339  NnrU family protein  59.9 
 
 
192 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  hitchhiker  0.000380877 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0785  membrane protein, NnrU-like  58.85 
 
 
192 aa  222  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518378  normal  0.183308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3458  NnrU  57.81 
 
 
192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4908  NnrU family protein  57.81 
 
 
192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5378  NnrU family protein  57.81 
 
 
192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1757  hypothetical protein  58.64 
 
 
300 aa  207  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2220  hypothetical protein  57.59 
 
 
284 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.049267  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0839  hypothetical protein  57.07 
 
 
194 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0061  hypothetical protein  57.07 
 
 
289 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71603  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1240  NnrU family protein  52.38 
 
 
199 aa  204  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0988023  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3706  NnrU family protein  55.21 
 
 
192 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0997157  normal  0.891439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0005  NnrU family protein  68.06 
 
 
191 aa  202  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.977134  normal  0.174949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0338  NnrU family protein  66.67 
 
 
192 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0970  NnrU protein  57.07 
 
 
298 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0878  NnrU protein  57.07 
 
 
194 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1433  NnrUfamily protein  52.6 
 
 
193 aa  185  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  46.88 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5584  NnrU family protein  49.72 
 
 
192 aa  161  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14562  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  45.31 
 
 
194 aa  157  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  42.27 
 
 
193 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4512  NnrU family protein  41.9 
 
 
195 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0981714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  41.97 
 
 
201 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  43.23 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  45.83 
 
 
188 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  52.26 
 
 
201 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  50.97 
 
 
201 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  50.97 
 
 
201 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0055  NnrU family protein  46.86 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  40.93 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  40.93 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0702  NnrU  45.65 
 
 
189 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.970605  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  40.93 
 
 
194 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  42.33 
 
 
190 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  40.21 
 
 
191 aa  121  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  40.93 
 
 
194 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  37.82 
 
 
194 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  37.37 
 
 
185 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  43.15 
 
 
189 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4623  NnrUfamily protein  45.83 
 
 
197 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  44.12 
 
 
197 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  44.97 
 
 
185 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  42.29 
 
 
203 aa  101  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2392  putative membrane protein, periplasmic nitrate reductase NnuR  35.06 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1056  NnrU family protein  34.48 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2631  NnrU family protein  39.86 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0971  hypothetical protein  39.86 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1880  NnrU family protein  34.29 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0083  NnrU family protein  38.85 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2873  putative NnrU protein  42.96 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  30.38 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  41.43 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2487  NnrU family protein  33.91 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000240954  hitchhiker  0.0000884748 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0564  NnrU family protein  38.13 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0844021 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  27.31 
 
 
237 aa  58.2  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0815  NnrU  35.57 
 
 
187 aa  58.2  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  29.58 
 
 
226 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0957  NnrU  27.88 
 
 
233 aa  52.4  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  33.88 
 
 
230 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  28.4 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0540  NnrU family protein  29.29 
 
 
258 aa  45.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  43.64 
 
 
231 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0318  hypothetical protein  28.86 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  30.23 
 
 
238 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  37.29 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>