91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3577 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  100 
 
 		 234 aa  457  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  43.86 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  34.36 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1672  NnrUfamily protein  33.78 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  38.04 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  34.96 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4038  NnrU  33.78 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  38.97 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3792  NnrU  35 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  34.64 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  37.16 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2079  NnrUfamily protein  31.96 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4739  putative MFS superfamily permease  32 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0110398  normal  0.189563 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0540  NnrU family protein  33.33 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0957  NnrU  32.62 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  30.91 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  30.45 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  34.36 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0162  NnrU  29.87 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2010  NnrU  30.73 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4512  NnrU family protein  27.5 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0981714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  29.13 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  28.24 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4908  NnrU family protein  30.11 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5378  NnrU family protein  30.11 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3458  NnrU  30.11 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  29.27 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0483  NnrUfamily protein  30.35 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0470  NnrUfamily protein  30.35 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1748  NnrU  29.24 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0318  hypothetical protein  33.72 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01651  hypothetical protein  27.19 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  31.3 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0785  membrane protein, NnrU-like  28.51 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518378  normal  0.183308 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0150  hypothetical protein  26.73 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  33.14 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  27.74 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0147  NnrUfamily protein  29.71 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  28.66 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1433  NnrUfamily protein  31.67 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  28.66 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01761  hypothetical protein  25.47 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.555031  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01671  hypothetical protein  26.27 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2728  NnrU  28.44 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17336  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  26.71 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1979  membrane protein-like  30.57 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.460955  normal  0.262447 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2399  hypothetical protein  28.57 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  28.75 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  25.47 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3706  NnrU family protein  28.41 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0997157  normal  0.891439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1240  NnrU family protein  29.76 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0988023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0055  hypothetical protein  29.34 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.402029  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  27.33 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  26.38 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1514  hypothetical protein  29.53 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4856  NnrU family protein  26.7 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486506  normal  0.0137655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  28.66 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4339  NnrU family protein  26.06 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  hitchhiker  0.000380877 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16955  predicted protein  29.14 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01631  hypothetical protein  29.69 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0006  NnrU  26.55 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3165  NnrUfamily protein  28.26 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  26.32 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0008  NnrU  28.86 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02201  hypothetical protein  24.87 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.348814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  28.82 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26691  hypothetical protein  27.57 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0338  NnrU family protein  29.73 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0460  NnrUfamily protein  26.74 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0005  NnrU family protein  28.17 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.977134  normal  0.174949 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2220  hypothetical protein  28.57 
 
 		 284 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.049267  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0702  NnrU  26.98 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.970605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4623  NnrUfamily protein  29.05 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125024  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0061  hypothetical protein  28.57 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0839  hypothetical protein  27.98 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0294  hypothetical protein  25.73 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  27.33 
 
 		 185 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1757  hypothetical protein  26.75 
 
 		 300 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63393  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  28.07 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0970  NnrU protein  30.71 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  33 
 
 		 182 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  29.07 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  27.03 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0878  NnrU protein  31.43 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46938  predicted protein  30.84 
 
 		 387 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2631  NnrU family protein  46.67 
 
 		 184 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0971  hypothetical protein  46.67 
 
 		 184 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0083  NnrU family protein  46.67 
 
 		 184 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5584  NnrU family protein  25.9 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2873  putative NnrU protein  68.97 
 
 		 187 aa  42.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2487  NnrU family protein  30.65 
 
 		 186 aa  41.6  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000240954  hitchhiker  0.0000884748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>