31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1748 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1748  NnrU  100 
 
 
238 aa  478  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493483  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0147  NnrUfamily protein  84.03 
 
 
238 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2010  NnrU  77.22 
 
 
237 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3165  NnrUfamily protein  74.58 
 
 
240 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0483  NnrUfamily protein  75.97 
 
 
257 aa  357  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0470  NnrUfamily protein  75.97 
 
 
257 aa  356  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0460  NnrUfamily protein  74.68 
 
 
238 aa  355  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1979  membrane protein-like  68.4 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.460955  normal  0.262447 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2399  hypothetical protein  62.21 
 
 
243 aa  290  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01631  hypothetical protein  59.56 
 
 
245 aa  287  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1514  hypothetical protein  58.41 
 
 
248 aa  284  8e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26691  hypothetical protein  57.78 
 
 
278 aa  282  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0294  hypothetical protein  63.11 
 
 
243 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02201  hypothetical protein  56.19 
 
 
248 aa  279  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.348814  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01671  hypothetical protein  60.83 
 
 
242 aa  278  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01651  hypothetical protein  60.83 
 
 
242 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0150  hypothetical protein  59.91 
 
 
242 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01761  hypothetical protein  58.08 
 
 
242 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.555031  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16955  predicted protein  57.21 
 
 
231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  29.24 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  27.07 
 
 
226 aa  55.8  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0957  NnrU  25.37 
 
 
233 aa  52.8  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  36.14 
 
 
230 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46938  predicted protein  27.23 
 
 
387 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  29.06 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  34.15 
 
 
229 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4739  putative MFS superfamily permease  26.25 
 
 
230 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0110398  normal  0.189563 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  32.43 
 
 
237 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0162  NnrU  26.51 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  30.95 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2079  NnrUfamily protein  26.83 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.520546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>