23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2079 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2079  NnrUfamily protein  100 
 
 		 230 aa  441  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4739  putative MFS superfamily permease  72.17 
 
 		 230 aa  325  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0110398  normal  0.189563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0957  NnrU  46.55 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0162  NnrU  40.26 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  33.79 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4038  NnrU  35.75 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1672  NnrUfamily protein  38.78 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  32.59 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  35.37 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  41.05 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3792  NnrU  38.3 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  32 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  34.09 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  27.84 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  33.92 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0540  NnrU family protein  31.52 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  29.07 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  29.56 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0318  hypothetical protein  29.22 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  26.89 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0147  NnrUfamily protein  30.95 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2010  NnrU  26.83 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1748  NnrU  26.83 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>