28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4739 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4739  putative MFS superfamily permease  100 
 
 		 230 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0110398  normal  0.189563 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2079  NnrUfamily protein  72.17 
 
 		 230 aa  330  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0957  NnrU  48.28 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0162  NnrU  38.2 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  35.11 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  31.34 
 
 		 234 aa  91.7  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  35.09 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4038  NnrU  34.03 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  30.87 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  37.16 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1672  NnrUfamily protein  32.46 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  31.63 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  30.64 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  35.47 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3792  NnrU  34.21 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0540  NnrU family protein  26.8 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2010  NnrU  30 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  28.3 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0147  NnrUfamily protein  25.85 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  26.82 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0318  hypothetical protein  26.06 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1748  NnrU  26.25 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0460  NnrUfamily protein  28.3 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3165  NnrUfamily protein  33.64 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0470  NnrUfamily protein  27.38 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0483  NnrUfamily protein  27.38 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2728  NnrU  33.33 
 
 		 226 aa  42  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17336  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01761  hypothetical protein  22.15 
 
 		 242 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.555031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>