51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2728 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2728  NnrU  100 
 
 		 226 aa  427  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17336  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4038  NnrU  40.88 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1672  NnrUfamily protein  38.28 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  37.72 
 
 		 238 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0540  NnrU family protein  37.42 
 
 		 258 aa  98.6  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3792  NnrU  37.55 
 
 		 230 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  38.55 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  35.44 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  41.86 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  34.68 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  35.76 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  36.84 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0318  hypothetical protein  36.18 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  28.44 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  38.18 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  31.28 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  31.37 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  34.01 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  33.75 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  29.52 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  33.75 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  28.7 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  31.08 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  33.75 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2334  NnrU family protein  39.13 
 
 		 169 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0549037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5378  NnrU family protein  28.64 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  27.7 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4908  NnrU family protein  28.64 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3458  NnrU  28.64 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  29.8 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  27.78 
 
 		 189 aa  52  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  33.33 
 
 		 194 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  29.25 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  28.9 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0785  membrane protein, NnrU-like  29.55 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518378  normal  0.183308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  31.51 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  29.56 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  31.08 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  32.19 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  29.86 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4856  NnrU family protein  28.77 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486506  normal  0.0137655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  28.77 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4623  NnrUfamily protein  30.77 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125024  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0162  NnrU  27.01 
 
 		 226 aa  45.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0957  NnrU  29.77 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3706  NnrU family protein  29.38 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0997157  normal  0.891439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  28.07 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4339  NnrU family protein  28.77 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  hitchhiker  0.000380877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1056  NnrU family protein  37.86 
 
 		 185 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  26.58 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2392  putative membrane protein, periplasmic nitrate reductase NnuR  37.86 
 
 		 185 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>