57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0318 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0318  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  97.4 
 
 		 231 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  83.91 
 
 		 231 aa  363  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  45.61 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4038  NnrU  43.04 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1672  NnrUfamily protein  43.91 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3792  NnrU  44.35 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0540  NnrU family protein  44.1 
 
 		 258 aa  151  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  40 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  33.78 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  45.24 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  40.83 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  33.19 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2334  NnrU family protein  45.28 
 
 		 169 aa  89.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0549037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  45.6 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2728  NnrU  36.81 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  34.09 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  33.06 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  26.79 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  26.15 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2079  NnrUfamily protein  29.3 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  29.25 
 
 		 194 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0162  NnrU  34.06 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  41.27 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  41.27 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  32.17 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  41.27 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  27.7 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  28.57 
 
 		 194 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  30.26 
 
 		 185 aa  48.9  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4339  NnrU family protein  41.27 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  hitchhiker  0.000380877 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4856  NnrU family protein  41.27 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486506  normal  0.0137655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4739  putative MFS superfamily permease  25.9 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0110398  normal  0.189563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  38.46 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0006  NnrU  35.09 
 
 		 192 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23902  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3706  NnrU family protein  27.11 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0997157  normal  0.891439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  23.53 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0005  NnrU family protein  32.28 
 
 		 191 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.977134  normal  0.174949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  26.03 
 
 		 189 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  25.91 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0055  hypothetical protein  31.94 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.402029  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3458  NnrU  38.1 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0008  NnrU  26.71 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  25.91 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4908  NnrU family protein  38.1 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5378  NnrU family protein  38.1 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  33 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  24.32 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  30.07 
 
 		 188 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  48.72 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  44.74 
 
 		 197 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  32.45 
 
 		 189 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1056  NnrU family protein  38.46 
 
 		 185 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2392  putative membrane protein, periplasmic nitrate reductase NnuR  38.46 
 
 		 185 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  27.21 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1880  NnrU family protein  38.46 
 
 		 196 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0785  membrane protein, NnrU-like  42.55 
 
 		 192 aa  41.6  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518378  normal  0.183308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>