72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1196 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  100 
 
 
185 aa  359  1e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3706  NnrU family protein  42.86 
 
 
192 aa  121  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0997157  normal  0.891439 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1757  hypothetical protein  46.56 
 
 
300 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63393  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0839  hypothetical protein  46.03 
 
 
194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0061  hypothetical protein  46.03 
 
 
289 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71603  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0785  membrane protein, NnrU-like  42.86 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518378  normal  0.183308 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2220  hypothetical protein  45.5 
 
 
284 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.049267  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5378  NnrU family protein  40.74 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4908  NnrU family protein  40.74 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3458  NnrU  40.74 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  39.51 
 
 
201 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  37.23 
 
 
185 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  39.38 
 
 
201 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4856  NnrU family protein  40.93 
 
 
192 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486506  normal  0.0137655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4339  NnrU family protein  40.93 
 
 
192 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  hitchhiker  0.000380877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  38.75 
 
 
201 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  37.89 
 
 
194 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  37.89 
 
 
194 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  36.84 
 
 
188 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  33.86 
 
 
190 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  37.37 
 
 
194 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  36.84 
 
 
194 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  36.51 
 
 
201 aa  98.6  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0055  hypothetical protein  44.3 
 
 
192 aa  97.8  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.402029  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  35.6 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  36.46 
 
 
189 aa  95.1  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0006  NnrU  40.54 
 
 
192 aa  94.7  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  36.52 
 
 
197 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  35.79 
 
 
191 aa  92  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0338  NnrU family protein  44.37 
 
 
192 aa  92  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  34.78 
 
 
203 aa  92  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0878  NnrU protein  44.97 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4623  NnrUfamily protein  35.96 
 
 
197 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125024  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0970  NnrU protein  44.97 
 
 
298 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5584  NnrU family protein  37.14 
 
 
192 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14562  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  38.17 
 
 
194 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0005  NnrU family protein  43.97 
 
 
191 aa  89  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.977134  normal  0.174949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  35.79 
 
 
194 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  34.21 
 
 
193 aa  87  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  35.98 
 
 
189 aa  85.5  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4512  NnrU family protein  34.66 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0981714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0702  NnrU  36.16 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.970605  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1240  NnrU family protein  34.68 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0988023  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1433  NnrUfamily protein  36.24 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0008  NnrU  40 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2487  NnrU family protein  29.17 
 
 
186 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000240954  hitchhiker  0.0000884748 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1880  NnrU family protein  34.43 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  31.29 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0055  NnrU family protein  37.29 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1056  NnrU family protein  34.42 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2392  putative membrane protein, periplasmic nitrate reductase NnuR  34.42 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  27.59 
 
 
228 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0971  hypothetical protein  31.52 
 
 
184 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2631  NnrU family protein  31.52 
 
 
184 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  28.78 
 
 
230 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0083  NnrU family protein  30.99 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0540  NnrU family protein  29.25 
 
 
258 aa  51.6  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  27.33 
 
 
234 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  31.33 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2728  NnrU  29.5 
 
 
226 aa  48.5  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17336  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  29.8 
 
 
229 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2873  putative NnrU protein  27.17 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  26.15 
 
 
238 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  28.78 
 
 
230 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0564  NnrU family protein  28.03 
 
 
183 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0844021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0815  NnrU  35.87 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  28.99 
 
 
226 aa  45.1  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0318  hypothetical protein  30.22 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  45.28 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  28.12 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4038  NnrU  27.59 
 
 
242 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1672  NnrUfamily protein  25.52 
 
 
230 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>