59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1240 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1240  NnrU family protein  100 
 
 		 199 aa  396  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0988023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1433  NnrUfamily protein  68.09 
 
 		 193 aa  250  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4856  NnrU family protein  53.93 
 
 		 192 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486506  normal  0.0137655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4339  NnrU family protein  53.12 
 
 		 192 aa  204  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  hitchhiker  0.000380877 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0839  hypothetical protein  55.21 
 
 		 194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2220  hypothetical protein  54.69 
 
 		 284 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.049267  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0061  hypothetical protein  55.21 
 
 		 289 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71603  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5378  NnrU family protein  51.83 
 
 		 192 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4908  NnrU family protein  51.83 
 
 		 192 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3458  NnrU  51.83 
 
 		 192 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0006  NnrU  57.67 
 
 		 192 aa  198  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23902  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0785  membrane protein, NnrU-like  51.83 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518378  normal  0.183308 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1757  hypothetical protein  54.17 
 
 		 300 aa  194  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63393  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3706  NnrU family protein  50.79 
 
 		 192 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0997157  normal  0.891439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0055  hypothetical protein  54.45 
 
 		 192 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.402029  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0970  NnrU protein  54.69 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0878  NnrU protein  54.69 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5584  NnrU family protein  52.54 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0008  NnrU  51.7 
 
 		 192 aa  174  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0338  NnrU family protein  57.45 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  40.53 
 
 		 193 aa  158  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  41.58 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  40.53 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0005  NnrU family protein  51.85 
 
 		 191 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.977134  normal  0.174949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  41.67 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4512  NnrU family protein  40.91 
 
 		 195 aa  131  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0981714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  38.86 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  38.02 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0055  NnrU family protein  42.7 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  38.95 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  40.43 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0702  NnrU  41.11 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.970605  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  42.13 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  42.13 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  38.54 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  42.13 
 
 		 201 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  37.89 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  38.54 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  39.44 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  34.74 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4623  NnrUfamily protein  43.86 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125024  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  35.94 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  35.57 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  35.79 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  39.77 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  34.68 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2631  NnrU family protein  32.39 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0971  hypothetical protein  32.39 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0083  NnrU family protein  31.11 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0564  NnrU family protein  32.89 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0844021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  29.76 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  33.06 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2873  putative NnrU protein  32.69 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  28.06 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2392  putative membrane protein, periplasmic nitrate reductase NnuR  30.68 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2487  NnrU family protein  28.38 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000240954  hitchhiker  0.0000884748 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1880  NnrU family protein  29.61 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1056  NnrU family protein  30.11 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  27.78 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>