63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2220 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2220  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  547  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.049267  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0061  hypothetical protein  99.27 
 
 		 289 aa  500  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71603  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0970  NnrU protein  84.98 
 
 		 298 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1757  hypothetical protein  92.24 
 
 		 300 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63393  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0839  hypothetical protein  99.48 
 
 		 194 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0878  NnrU protein  99.48 
 
 		 194 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4339  NnrU family protein  71.88 
 
 		 192 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  hitchhiker  0.000380877 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0785  membrane protein, NnrU-like  71.88 
 
 		 192 aa  271  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518378  normal  0.183308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4856  NnrU family protein  71.2 
 
 		 192 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486506  normal  0.0137655 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4908  NnrU family protein  68.23 
 
 		 192 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3458  NnrU  68.23 
 
 		 192 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5378  NnrU family protein  68.23 
 
 		 192 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3706  NnrU family protein  68.59 
 
 		 192 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0997157  normal  0.891439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1240  NnrU family protein  54.69 
 
 		 199 aa  199  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0988023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0006  NnrU  55.73 
 
 		 192 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0055  hypothetical protein  57.07 
 
 		 192 aa  186  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.402029  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5584  NnrU family protein  51.41 
 
 		 192 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0008  NnrU  56.5 
 
 		 192 aa  175  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0338  NnrU family protein  59.69 
 
 		 192 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1433  NnrUfamily protein  53.19 
 
 		 193 aa  168  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0005  NnrU family protein  56.84 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.977134  normal  0.174949 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  42.71 
 
 		 194 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  43.98 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  43.23 
 
 		 194 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0055  NnrU family protein  45.3 
 
 		 193 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  40.21 
 
 		 194 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4512  NnrU family protein  39.55 
 
 		 195 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0981714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  40.51 
 
 		 194 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  38.86 
 
 		 201 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0702  NnrU  44.44 
 
 		 189 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.970605  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  42.78 
 
 		 189 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  49.67 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  46.71 
 
 		 201 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  40.74 
 
 		 188 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  40.21 
 
 		 194 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  48.37 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  38.66 
 
 		 194 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  45.5 
 
 		 185 aa  112  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  41.05 
 
 		 190 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  39.18 
 
 		 194 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  37.77 
 
 		 191 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  38.51 
 
 		 189 aa  102  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  43.58 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  36.36 
 
 		 185 aa  99.4  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4623  NnrUfamily protein  43.58 
 
 		 197 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125024  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  41.04 
 
 		 203 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1880  NnrU family protein  34.62 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1056  NnrU family protein  35.63 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2392  putative membrane protein, periplasmic nitrate reductase NnuR  35.63 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0083  NnrU family protein  34.36 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2631  NnrU family protein  33.85 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0971  hypothetical protein  33.85 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  32.47 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0564  NnrU family protein  33.68 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0844021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2873  putative NnrU protein  31.79 
 
 		 187 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  28.57 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  26.38 
 
 		 237 aa  49.3  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0815  NnrU  30.87 
 
 		 187 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  28.38 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  29.09 
 
 		 228 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2487  NnrU family protein  30.08 
 
 		 186 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000240954  hitchhiker  0.0000884748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  30 
 
 		 230 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  27.97 
 
 		 231 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>