70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3706 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3706  NnrU family protein  100 
 
 
192 aa  361  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0997157  normal  0.891439 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4908  NnrU family protein  81.77 
 
 
192 aa  304  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3458  NnrU  81.77 
 
 
192 aa  304  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5378  NnrU family protein  81.77 
 
 
192 aa  304  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0785  membrane protein, NnrU-like  81.25 
 
 
192 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518378  normal  0.183308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4856  NnrU family protein  80.73 
 
 
192 aa  299  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486506  normal  0.0137655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4339  NnrU family protein  79.69 
 
 
192 aa  294  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  hitchhiker  0.000380877 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0839  hypothetical protein  69.11 
 
 
194 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0061  hypothetical protein  69.11 
 
 
289 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71603  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2220  hypothetical protein  68.59 
 
 
284 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.049267  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1757  hypothetical protein  68.06 
 
 
300 aa  249  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63393  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0970  NnrU protein  68.06 
 
 
298 aa  228  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0878  NnrU protein  68.06 
 
 
194 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5584  NnrU family protein  58.76 
 
 
192 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14562  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1240  NnrU family protein  50.79 
 
 
199 aa  191  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0988023  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0006  NnrU  57.51 
 
 
192 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0055  hypothetical protein  56.77 
 
 
192 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.402029  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0008  NnrU  54.19 
 
 
192 aa  177  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1433  NnrUfamily protein  49.48 
 
 
193 aa  170  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0338  NnrU family protein  54.17 
 
 
192 aa  161  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0005  NnrU family protein  55.79 
 
 
191 aa  155  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.977134  normal  0.174949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  41.88 
 
 
193 aa  147  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  42.19 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  39.58 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  41.67 
 
 
201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  41.08 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0055  NnrU family protein  42.13 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4512  NnrU family protein  38.76 
 
 
195 aa  124  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0981714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  42.86 
 
 
185 aa  121  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  36.13 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0702  NnrU  42.05 
 
 
189 aa  119  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.970605  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  36.65 
 
 
194 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  36.13 
 
 
194 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  37.04 
 
 
188 aa  111  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  34.55 
 
 
194 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  38.22 
 
 
190 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  34.74 
 
 
189 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  36.81 
 
 
191 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  39.09 
 
 
201 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  38.32 
 
 
201 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  38.32 
 
 
201 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  34.66 
 
 
185 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  43.68 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  35.6 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  39.31 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4623  NnrUfamily protein  41.38 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125024  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0564  NnrU family protein  31.61 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0844021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2873  putative NnrU protein  32.65 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1880  NnrU family protein  31.28 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2487  NnrU family protein  30.37 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000240954  hitchhiker  0.0000884748 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2631  NnrU family protein  27.08 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0971  hypothetical protein  27.08 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1056  NnrU family protein  31.28 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0083  NnrU family protein  27.75 
 
 
184 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2392  putative membrane protein, periplasmic nitrate reductase NnuR  30.73 
 
 
185 aa  61.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  38.64 
 
 
182 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  28.41 
 
 
234 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0815  NnrU  31.54 
 
 
187 aa  58.2  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  26.86 
 
 
237 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  31.93 
 
 
238 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  34.38 
 
 
230 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  41.51 
 
 
229 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0318  hypothetical protein  41.27 
 
 
231 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4928  hypothetical protein  68.75 
 
 
41 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3235  hypothetical protein  68.75 
 
 
41 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.420046 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  41.27 
 
 
231 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  46.81 
 
 
231 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  28.78 
 
 
230 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  27.33 
 
 
228 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0957  NnrU  26.53 
 
 
233 aa  41.6  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>