70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4908 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5378  NnrU family protein  100 
 
 
192 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4908  NnrU family protein  100 
 
 
192 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3458  NnrU  100 
 
 
192 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4856  NnrU family protein  88.54 
 
 
192 aa  328  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486506  normal  0.0137655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4339  NnrU family protein  87.5 
 
 
192 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  hitchhiker  0.000380877 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0785  membrane protein, NnrU-like  88.02 
 
 
192 aa  322  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518378  normal  0.183308 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3706  NnrU family protein  81.77 
 
 
192 aa  304  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0997157  normal  0.891439 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0061  hypothetical protein  69.11 
 
 
289 aa  259  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0839  hypothetical protein  69.11 
 
 
194 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2220  hypothetical protein  68.23 
 
 
284 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.049267  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1757  hypothetical protein  68.06 
 
 
300 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63393  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0970  NnrU protein  68.06 
 
 
298 aa  235  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0878  NnrU protein  68.06 
 
 
194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5584  NnrU family protein  58.19 
 
 
192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14562  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1240  NnrU family protein  51.83 
 
 
199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0988023  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0006  NnrU  55.73 
 
 
192 aa  194  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0008  NnrU  56.42 
 
 
192 aa  191  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0055  hypothetical protein  55.73 
 
 
192 aa  189  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.402029  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1433  NnrUfamily protein  50.52 
 
 
193 aa  173  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0338  NnrU family protein  55.21 
 
 
192 aa  167  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0005  NnrU family protein  57.89 
 
 
191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.977134  normal  0.174949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  42.41 
 
 
193 aa  144  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  40.93 
 
 
194 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  42.78 
 
 
189 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  37.5 
 
 
194 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0055  NnrU family protein  42.13 
 
 
193 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0702  NnrU  45.25 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.970605  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4512  NnrU family protein  38.2 
 
 
195 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0981714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  37.82 
 
 
201 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  37.17 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  42.93 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  38.02 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  37.17 
 
 
194 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  38.22 
 
 
194 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  39.8 
 
 
201 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  39.8 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  39.8 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  37.17 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  40.74 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  41.62 
 
 
203 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  34.36 
 
 
191 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  35.26 
 
 
189 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  37.17 
 
 
194 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4623  NnrUfamily protein  44.51 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  43.93 
 
 
197 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  32.98 
 
 
185 aa  94.7  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0971  hypothetical protein  31.25 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2631  NnrU family protein  31.25 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1056  NnrU family protein  33.51 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1880  NnrU family protein  31.94 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2392  putative membrane protein, periplasmic nitrate reductase NnuR  32.98 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0564  NnrU family protein  35.14 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0844021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  30.11 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  33.68 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0083  NnrU family protein  32.02 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2487  NnrU family protein  27.41 
 
 
186 aa  62  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000240954  hitchhiker  0.0000884748 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2873  putative NnrU protein  32.68 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0815  NnrU  31.54 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  26.86 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3235  hypothetical protein  71.88 
 
 
41 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.420046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4928  hypothetical protein  71.88 
 
 
41 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2728  NnrU  28.64 
 
 
226 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17336  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  27.33 
 
 
228 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  35.14 
 
 
230 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  39.68 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0318  hypothetical protein  38.1 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  38.1 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  26.64 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  28.66 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  30 
 
 
230 aa  41.2  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>