72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3521 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  100 
 
 		 182 aa  358  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2873  putative NnrU protein  56.59 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0083  NnrU family protein  52.75 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0971  hypothetical protein  50.55 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2631  NnrU family protein  50.55 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0564  NnrU family protein  49.46 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0844021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0815  NnrU  48.62 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1056  NnrU family protein  44.51 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2392  putative membrane protein, periplasmic nitrate reductase NnuR  43.96 
 
 		 185 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1880  NnrU family protein  42.86 
 
 		 196 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  34.3 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  35.47 
 
 		 194 aa  97.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  36.48 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  37.27 
 
 		 191 aa  95.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  34.5 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  33.14 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  38.51 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  34.3 
 
 		 194 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  37.67 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  37.67 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  31.31 
 
 		 201 aa  84.7  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  40.14 
 
 		 201 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  35.81 
 
 		 194 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  32.78 
 
 		 190 aa  77.4  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  41.6 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4512  NnrU family protein  38.52 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0981714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  29.21 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4908  NnrU family protein  33.68 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3458  NnrU  33.68 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5378  NnrU family protein  33.68 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  42.48 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2220  hypothetical protein  32.47 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.049267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4623  NnrUfamily protein  38.53 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2487  NnrU family protein  34.68 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000240954  hitchhiker  0.0000884748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0785  membrane protein, NnrU-like  31.09 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518378  normal  0.183308 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0061  hypothetical protein  31.96 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71603  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  29.03 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0839  hypothetical protein  31.96 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0338  NnrU family protein  36.43 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1433  NnrUfamily protein  33.54 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0055  hypothetical protein  37.86 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.402029  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  30.73 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1240  NnrU family protein  32.22 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0988023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0006  NnrU  33.11 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23902  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4856  NnrU family protein  30.41 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486506  normal  0.0137655 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1757  hypothetical protein  32.47 
 
 		 300 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63393  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  32.4 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4339  NnrU family protein  30.93 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  hitchhiker  0.000380877 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3706  NnrU family protein  29.69 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0997157  normal  0.891439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  35.14 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0702  NnrU  30.86 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.970605  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5584  NnrU family protein  31.95 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0005  NnrU family protein  36.5 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.977134  normal  0.174949 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0878  NnrU protein  29.9 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0970  NnrU protein  29.9 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0008  NnrU  40.54 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  31.2 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0540  NnrU family protein  30.66 
 
 		 258 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  32.65 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  30.94 
 
 		 234 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  31.33 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  39.29 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  35.38 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  44.19 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0957  NnrU  29.86 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1672  NnrUfamily protein  27.27 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0318  hypothetical protein  48.72 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  48.72 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0055  NnrU family protein  31.25 
 
 		 193 aa  42  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2334  NnrU family protein  33.78 
 
 		 169 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0549037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4038  NnrU  25 
 
 		 242 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2728  NnrU  28.7 
 
 		 226 aa  41.2  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>