62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1963 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  100 
 
 		 231 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0318  hypothetical protein  97.4 
 
 		 231 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  83.04 
 
 		 231 aa  357  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  45.18 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4038  NnrU  43.48 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3792  NnrU  44.35 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1672  NnrUfamily protein  43.48 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0540  NnrU family protein  43.29 
 
 		 258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  38.73 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  33.78 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  44 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  41.42 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  32.89 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2334  NnrU family protein  45.28 
 
 		 169 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0549037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  45.6 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  33.52 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2728  NnrU  37.5 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17336  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  32.64 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0162  NnrU  30.56 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2079  NnrUfamily protein  29.63 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  26.79 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  29.93 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  32.73 
 
 		 193 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  29.93 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  28.38 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  41.27 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  41.27 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  31.47 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  41.27 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  28.32 
 
 		 185 aa  48.5  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4339  NnrU family protein  41.27 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  hitchhiker  0.000380877 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4856  NnrU family protein  41.27 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486506  normal  0.0137655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4739  putative MFS superfamily permease  26.67 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0110398  normal  0.189563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  26.71 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  38.46 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3706  NnrU family protein  27.71 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0997157  normal  0.891439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  33 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0006  NnrU  35.09 
 
 		 192 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  27.4 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0055  hypothetical protein  32.64 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.402029  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  25.91 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0005  NnrU family protein  33.07 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.977134  normal  0.174949 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4908  NnrU family protein  38.1 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3458  NnrU  38.1 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0008  NnrU  37.29 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5378  NnrU family protein  38.1 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  30.07 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  27.89 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  27.27 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0839  hypothetical protein  27.95 
 
 		 194 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  44.74 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0061  hypothetical protein  28.67 
 
 		 289 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71603  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  32.89 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  48.72 
 
 		 182 aa  42.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1056  NnrU family protein  38.46 
 
 		 185 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  47.22 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2392  putative membrane protein, periplasmic nitrate reductase NnuR  38.46 
 
 		 185 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1880  NnrU family protein  38.46 
 
 		 196 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2220  hypothetical protein  27.97 
 
 		 284 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.049267  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0083  NnrU family protein  26.4 
 
 		 184 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2873  putative NnrU protein  37.04 
 
 		 187 aa  41.6  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1757  hypothetical protein  27.97 
 
 		 300 aa  41.6  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>