23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0162 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0162  NnrU  100 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2079  NnrUfamily protein  40.83 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4739  putative MFS superfamily permease  38.99 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0110398  normal  0.189563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0957  NnrU  37.17 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  29.87 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  29.61 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1672  NnrUfamily protein  32.97 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  28.82 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  31.61 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  35.84 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  30.93 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4038  NnrU  28.65 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0540  NnrU family protein  27.64 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  31.51 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  30 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  31.61 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3165  NnrUfamily protein  27.62 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2487  NnrU family protein  27.88 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000240954  hitchhiker  0.0000884748 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0318  hypothetical protein  34.13 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1748  NnrU  26.51 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0147  NnrUfamily protein  26.19 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0150  hypothetical protein  26.97 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3792  NnrU  32.43 
 
 		 230 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>