54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1672 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1672  NnrUfamily protein  100 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4038  NnrU  82.89 
 
 		 242 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3792  NnrU  79.13 
 
 		 230 aa  334  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  68.28 
 
 		 238 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0540  NnrU family protein  48.25 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  44.16 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0318  hypothetical protein  43.91 
 
 		 231 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  43.48 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  47.89 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  48.02 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  37.61 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  39.15 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  43.92 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  33.78 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  35.85 
 
 		 226 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2728  NnrU  37.99 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17336  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2079  NnrUfamily protein  38.59 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2334  NnrU family protein  43.48 
 
 		 169 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0549037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4739  putative MFS superfamily permease  32.97 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0110398  normal  0.189563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0957  NnrU  32.42 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0162  NnrU  32.97 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  27.68 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  28.44 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  29.33 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  28 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  26.19 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  33.33 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  25.75 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  28 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  28.02 
 
 		 194 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0006  NnrU  32.14 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  25 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  26.87 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  28.3 
 
 		 185 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  28.4 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  23.14 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  26.03 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  29.41 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  25.3 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2010  NnrU  25.65 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  28.69 
 
 		 189 aa  46.2  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  25.77 
 
 		 189 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4623  NnrUfamily protein  28.44 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125024  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0564  NnrU family protein  46.81 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0844021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2487  NnrU family protein  21.8 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000240954  hitchhiker  0.0000884748 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4512  NnrU family protein  33.04 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0981714 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2631  NnrU family protein  38 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2399  hypothetical protein  26.77 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0971  hypothetical protein  38 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0083  NnrU family protein  39.58 
 
 		 184 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0008  NnrU  30.36 
 
 		 192 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  25.81 
 
 		 188 aa  42  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  25.52 
 
 		 185 aa  42  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  42.55 
 
 		 182 aa  42  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>