39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0957 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0957  NnrU  100 
 
 		 233 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4739  putative MFS superfamily permease  49.77 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0110398  normal  0.189563 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2079  NnrUfamily protein  48.4 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0162  NnrU  37.17 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  36.36 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  32.62 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4038  NnrU  34.76 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  32.62 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1672  NnrUfamily protein  31.38 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  34.51 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  31.18 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  35.88 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  28.95 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  31.65 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0540  NnrU family protein  26.46 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3792  NnrU  33.16 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.252316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  35.26 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  31.01 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  31.95 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1748  NnrU  25.37 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  30.77 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2010  NnrU  24.26 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  30.77 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0470  NnrUfamily protein  22.02 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0483  NnrUfamily protein  22.02 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1979  membrane protein-like  27.17 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.460955  normal  0.262447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  28 
 
 		 188 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  28.99 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  27.74 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0147  NnrUfamily protein  24.87 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3165  NnrUfamily protein  26.01 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0338  NnrU family protein  30.22 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0055  hypothetical protein  27.27 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.402029  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  26.17 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  26.45 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0460  NnrUfamily protein  23.65 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  27.33 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  25.81 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5584  NnrU family protein  30.58 
 
 		 192 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>