64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0338 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0338  NnrU family protein  100 
 
 		 192 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0055  hypothetical protein  70.31 
 
 		 192 aa  227  8e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.402029  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0006  NnrU  61.98 
 
 		 192 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0008  NnrU  66.48 
 
 		 192 aa  200  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1757  hypothetical protein  59.28 
 
 		 300 aa  194  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63393  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0839  hypothetical protein  59.16 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2220  hypothetical protein  59.69 
 
 		 284 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.049267  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0061  hypothetical protein  59.16 
 
 		 289 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71603  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4339  NnrU family protein  57.29 
 
 		 192 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  hitchhiker  0.000380877 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0785  membrane protein, NnrU-like  57.29 
 
 		 192 aa  191  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518378  normal  0.183308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4856  NnrU family protein  56.25 
 
 		 192 aa  190  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486506  normal  0.0137655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1240  NnrU family protein  51.83 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0988023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3458  NnrU  55.21 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4908  NnrU family protein  55.21 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5378  NnrU family protein  55.21 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3706  NnrU family protein  54.17 
 
 		 192 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0997157  normal  0.891439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1433  NnrUfamily protein  53.65 
 
 		 193 aa  171  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0970  NnrU protein  56.02 
 
 		 298 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0878  NnrU protein  56.02 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0005  NnrU family protein  64.21 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.977134  normal  0.174949 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5584  NnrU family protein  52.54 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  44.79 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  44.21 
 
 		 189 aa  144  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4512  NnrU family protein  46.63 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0981714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  42.71 
 
 		 194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  43.23 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  53.29 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  53.29 
 
 		 201 aa  131  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0702  NnrU  48.04 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.970605  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  53.29 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  42.49 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  45.21 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  44.04 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  42.49 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  41.97 
 
 		 194 aa  118  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  41.45 
 
 		 194 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0055  NnrU family protein  45.56 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  47.73 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  43.01 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  42.24 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  40.84 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  42.48 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  36.51 
 
 		 185 aa  98.2  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  43.71 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4623  NnrUfamily protein  47.62 
 
 		 197 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  46.43 
 
 		 197 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0971  hypothetical protein  32.46 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2631  NnrU family protein  32.46 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1056  NnrU family protein  38.69 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0564  NnrU family protein  36.79 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0844021 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2392  putative membrane protein, periplasmic nitrate reductase NnuR  38.69 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1880  NnrU family protein  36.5 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0083  NnrU family protein  32.98 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  33.16 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2873  putative NnrU protein  31.38 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0815  NnrU  31.58 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  28.02 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  27.54 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2487  NnrU family protein  30.14 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000240954  hitchhiker  0.0000884748 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0540  NnrU family protein  28.4 
 
 		 258 aa  48.5  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0957  NnrU  29.66 
 
 		 233 aa  47.8  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  26.09 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  27.09 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  28.92 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>