68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0083 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0083  NnrU family protein  100 
 
 		 184 aa  359  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2631  NnrU family protein  85.33 
 
 		 184 aa  315  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0971  hypothetical protein  85.33 
 
 		 184 aa  315  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2392  putative membrane protein, periplasmic nitrate reductase NnuR  51.09 
 
 		 185 aa  193  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1056  NnrU family protein  50.54 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1880  NnrU family protein  48.91 
 
 		 196 aa  187  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2873  putative NnrU protein  52.2 
 
 		 187 aa  167  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  52.75 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0564  NnrU family protein  49.18 
 
 		 183 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0844021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0815  NnrU  50.32 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  34.62 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2487  NnrU family protein  30.67 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000240954  hitchhiker  0.0000884748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  35.47 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  33.85 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  35.34 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  33.33 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  31.79 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  35.71 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  30.48 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  35.62 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  39.78 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  30.16 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  34.93 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  34.93 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  34.69 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4512  NnrU family protein  32.57 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0981714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  36.07 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1433  NnrUfamily protein  36.91 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0702  NnrU  33.12 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.970605  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0839  hypothetical protein  33.85 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2220  hypothetical protein  34.36 
 
 		 284 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.049267  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0061  hypothetical protein  33.85 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71603  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3458  NnrU  32.02 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5378  NnrU family protein  32.02 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1757  hypothetical protein  34.87 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63393  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4908  NnrU family protein  32.02 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1240  NnrU family protein  31.11 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0988023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0785  membrane protein, NnrU-like  32.29 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518378  normal  0.183308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0338  NnrU family protein  36.43 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  31.37 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  30.41 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  37.08 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4623  NnrUfamily protein  34.26 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125024  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3706  NnrU family protein  27.75 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0997157  normal  0.891439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0055  hypothetical protein  36.69 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.402029  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  32.11 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4856  NnrU family protein  30 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486506  normal  0.0137655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4339  NnrU family protein  29.53 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  hitchhiker  0.000380877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  39.56 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  48.21 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0878  NnrU protein  34.87 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0970  NnrU protein  34.87 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  29.36 
 
 		 229 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  26.67 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  32.86 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0008  NnrU  43.14 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  30.99 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0006  NnrU  30.41 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23902  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5584  NnrU family protein  31.07 
 
 		 192 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  37.5 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  44.68 
 
 		 238 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0540  NnrU family protein  46.67 
 
 		 258 aa  44.3  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  42.22 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  46.67 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1672  NnrUfamily protein  40.43 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  26.4 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0318  hypothetical protein  25.6 
 
 		 231 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4038  NnrU  40.43 
 
 		 242 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>