62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1880 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1880  NnrU family protein  100 
 
 		 196 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1056  NnrU family protein  92.43 
 
 		 185 aa  345  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2392  putative membrane protein, periplasmic nitrate reductase NnuR  91.89 
 
 		 185 aa  344  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0971  hypothetical protein  50.54 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2631  NnrU family protein  50.54 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0083  NnrU family protein  48.91 
 
 		 184 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  42.86 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2873  putative NnrU protein  41.44 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0564  NnrU family protein  38.25 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0844021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0815  NnrU  41.29 
 
 		 187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2487  NnrU family protein  32.93 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000240954  hitchhiker  0.0000884748 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  37.64 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0061  hypothetical protein  35.16 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71603  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2220  hypothetical protein  34.62 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.049267  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  40.29 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  40.44 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  40.44 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0839  hypothetical protein  35.63 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4512  NnrU family protein  39.13 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0981714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  32.16 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  33.52 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1757  hypothetical protein  33.87 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63393  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  33.51 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  30.68 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  31.75 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  33.89 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  34.44 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  31.25 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  34.09 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  34.43 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0970  NnrU protein  34.62 
 
 		 298 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4908  NnrU family protein  31.94 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  33.54 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  32.35 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3458  NnrU  31.94 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5378  NnrU family protein  31.94 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  38.06 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0338  NnrU family protein  36.5 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4856  NnrU family protein  31.41 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486506  normal  0.0137655 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0878  NnrU protein  35.06 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4339  NnrU family protein  30.37 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  hitchhiker  0.000380877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0055  hypothetical protein  35.19 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.402029  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3706  NnrU family protein  31.28 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0997157  normal  0.891439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0785  membrane protein, NnrU-like  31.61 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518378  normal  0.183308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0702  NnrU  35.62 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.970605  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1433  NnrUfamily protein  34.78 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0006  NnrU  36.5 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0008  NnrU  31.54 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0005  NnrU family protein  36.5 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.977134  normal  0.174949 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  34.85 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1240  NnrU family protein  29.61 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0988023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4623  NnrUfamily protein  39.23 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  38.66 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5584  NnrU family protein  32.88 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  27.45 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  28.66 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1963  NnrU family protein  38.46 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.867281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0318  hypothetical protein  38.46 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0976  NnrU family protein  44.44 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  37.7 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0540  NnrU family protein  61.29 
 
 		 258 aa  41.2  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>