56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0815 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0815  NnrU  100 
 
 
187 aa  362  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0564  NnrU family protein  57.07 
 
 
183 aa  181  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0844021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2873  putative NnrU protein  51.91 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3521  NnrU  48.62 
 
 
182 aa  148  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.401542  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0083  NnrU family protein  45.6 
 
 
184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2631  NnrU family protein  42.31 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0971  hypothetical protein  42.31 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1056  NnrU family protein  43.59 
 
 
185 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2392  putative membrane protein, periplasmic nitrate reductase NnuR  43.59 
 
 
185 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1880  NnrU family protein  41.29 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2487  NnrU family protein  35.1 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000240954  hitchhiker  0.0000884748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0785  membrane protein, NnrU-like  32.31 
 
 
192 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518378  normal  0.183308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1433  NnrUfamily protein  36.23 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4512  NnrU family protein  35.04 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0981714 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1389  hypothetical protein  28.65 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2275  NnrU  47.27 
 
 
194 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00915221  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3706  NnrU family protein  30.05 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0997157  normal  0.891439 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4339  NnrU family protein  31.44 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  hitchhiker  0.000380877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2848  NnrU family protein  29.38 
 
 
194 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0380559  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4856  NnrU family protein  30.41 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486506  normal  0.0137655 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3458  NnrU  29.56 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0055  hypothetical protein  32.92 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.402029  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4908  NnrU family protein  29.56 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5378  NnrU family protein  29.56 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3770  hypothetical protein  30.97 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3305  hypothetical protein  27.75 
 
 
201 aa  55.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129795  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3117  NnrUfamily protein  27.84 
 
 
194 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1682  NnrU  35.87 
 
 
194 aa  54.7  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262721  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2025  NnrU  40 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.813073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0531  NnrU-like protein  28.19 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1443  NnrU family protein  31.75 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.855742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0338  NnrU family protein  33.33 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3792  NnrUfamily protein  33.03 
 
 
190 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2444  NnrU  31.87 
 
 
194 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0839  hypothetical protein  27.6 
 
 
194 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4411  NnrUfamily protein  33.57 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3509  NnrUfamily protein  41.51 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4041  NnrU family protein  33.57 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.491224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0702  NnrU  29.61 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.970605  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4523  NnrUfamily protein  34.67 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.594059  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5584  NnrU family protein  28.49 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14562  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4623  NnrUfamily protein  42.86 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125024  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2220  hypothetical protein  28.12 
 
 
284 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.049267  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2606  NnrU family protein  44.68 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1757  hypothetical protein  27.08 
 
 
300 aa  48.9  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3009  NnrU  45.45 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779568  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  48.84 
 
 
228 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0061  hypothetical protein  27.6 
 
 
289 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71603  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3888  NnrU family protein  34.11 
 
 
203 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0506193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1196  NnrU family protein  30.58 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.532223  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1382  NnrU family protein  27.34 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.781737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0008  NnrU  52.08 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0005  NnrU family protein  50 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.977134  normal  0.174949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  47.73 
 
 
230 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0006  NnrU  45.45 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  43.18 
 
 
229 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>