57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2171 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3239  hypothetical protein  28.92 
 
 
215 aa  104  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303297  normal  0.187673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2950  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.56 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.59 
 
 
198 aa  79  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  27.6 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  28.67 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  40 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  31.93 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  31.93 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  26.7 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.7 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  30.65 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  31.31 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.19 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  29.15 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6423  hypothetical protein  29.37 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  31.67 
 
 
266 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13267  integral membrane protein  30.94 
 
 
244 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.849706  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  36.36 
 
 
271 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3864  hypothetical protein  36.11 
 
 
174 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3486  putative integral membrane protein  31.93 
 
 
257 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3499  putative integral membrane protein  31.93 
 
 
257 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3549  putative integral membrane protein  31.93 
 
 
257 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.393882  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  29.82 
 
 
252 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2947  putative integral membrane protein  29.2 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704391  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4814  putative integral membrane protein  23.88 
 
 
248 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  27.88 
 
 
252 aa  55.5  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  27.32 
 
 
196 aa  54.7  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  30.11 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0345  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase-like protein  33.67 
 
 
126 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.7101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2010  NnrU  25.87 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0910  hypothetical protein  33.77 
 
 
271 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  31.25 
 
 
169 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.06 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  31.52 
 
 
289 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.57 
 
 
196 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3165  NnrUfamily protein  31.82 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  32.22 
 
 
269 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.33 
 
 
157 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.87 
 
 
162 aa  45.1  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  28.74 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.19 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  32.94 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16955  predicted protein  29.76 
 
 
231 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  27.85 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  30.11 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1748  NnrU  30.95 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493483  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.42 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.43 
 
 
188 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.92 
 
 
191 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  31.82 
 
 
269 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  28.3 
 
 
168 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.18 
 
 
166 aa  41.6  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  28.44 
 
 
219 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25 
 
 
215 aa  41.2  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0730  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.67 
 
 
236 aa  41.2  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.776939  hitchhiker  0.000590903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>