28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3864 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3864  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  347  5e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3239  hypothetical protein  38.17 
 
 
215 aa  81.3  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303297  normal  0.187673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2950  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.6 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  36.11 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  32.47 
 
 
266 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  40 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  31.65 
 
 
213 aa  57.4  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  35.94 
 
 
252 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  31.91 
 
 
257 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  31.91 
 
 
257 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  41.1 
 
 
245 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4814  putative integral membrane protein  33.33 
 
 
248 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6423  hypothetical protein  43.48 
 
 
244 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  37.65 
 
 
242 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  41.18 
 
 
279 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.62 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.97 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  29.93 
 
 
196 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2947  putative integral membrane protein  33.61 
 
 
262 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704391  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  31.25 
 
 
193 aa  44.7  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  39.06 
 
 
223 aa  44.3  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  35.29 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13267  integral membrane protein  38.75 
 
 
244 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.849706  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0910  hypothetical protein  33.58 
 
 
271 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  28.05 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.14 
 
 
214 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.62 
 
 
189 aa  41.6  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>