56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0660 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  431  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  49.21 
 
 
196 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  44.39 
 
 
198 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  40.44 
 
 
193 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  39.3 
 
 
197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.34 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3239  hypothetical protein  30.61 
 
 
215 aa  72  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303297  normal  0.187673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  31.31 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.81 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  29.53 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  30.16 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  42.65 
 
 
252 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  35.25 
 
 
242 aa  62  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  26.53 
 
 
257 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  26.53 
 
 
257 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  28.72 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13267  integral membrane protein  38.89 
 
 
244 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.849706  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  27.27 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6423  hypothetical protein  41.89 
 
 
244 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3499  putative integral membrane protein  38.24 
 
 
257 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3549  putative integral membrane protein  38.24 
 
 
257 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.393882  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3486  putative integral membrane protein  38.24 
 
 
257 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4814  putative integral membrane protein  23.7 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0910  hypothetical protein  29.25 
 
 
271 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  29.17 
 
 
245 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2950  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.96 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  26.09 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3864  hypothetical protein  42.25 
 
 
174 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2947  putative integral membrane protein  33.9 
 
 
262 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704391  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  30.1 
 
 
252 aa  52  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  31.65 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  35.71 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.46 
 
 
220 aa  45.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  38.55 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.76 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  39.29 
 
 
194 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.48 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  39.29 
 
 
194 aa  45.4  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2219  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.38 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0421811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.93 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.78 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.04 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.98 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.71 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5094  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.76 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443323 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.52 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.65 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.8 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  27.4 
 
 
216 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  30.68 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.83 
 
 
189 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.83 
 
 
189 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.83 
 
 
189 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 
205 aa  41.6  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>