145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1062 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
205 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  36.63 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  36.63 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.25 
 
 
204 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0672  nickel-cobalt-cadmium resistance protein NCCN  39.63 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.14 
 
 
209 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  35.33 
 
 
273 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.57 
 
 
284 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.82 
 
 
206 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1015  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.81 
 
 
226 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0686836  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  36.2 
 
 
206 aa  94  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.48 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.3 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.22 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  34.45 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  41.11 
 
 
1020 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  40.21 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.46 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.27 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  37.12 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.39 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  38 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  37.12 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  36.36 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.65 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  39.58 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.9 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.11 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  37.61 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  37.76 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.04 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  35.4 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  35.4 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2346  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.63 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  39.56 
 
 
253 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.36 
 
 
215 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  36.17 
 
 
219 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.13 
 
 
189 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.17 
 
 
219 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.17 
 
 
219 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.17 
 
 
219 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.13 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.9 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  36.94 
 
 
254 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.9 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.29 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.9 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.36 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.96 
 
 
221 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.93 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  36.96 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.69 
 
 
215 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.06 
 
 
189 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.56 
 
 
218 aa  57.4  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.14 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.73 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.19 
 
 
220 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  30 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.99 
 
 
242 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.06 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.06 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.06 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4835  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.05 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0530651  normal  0.102652 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.06 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  34.34 
 
 
214 aa  55.1  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.46 
 
 
189 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.94 
 
 
221 aa  54.7  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.57 
 
 
214 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.62 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  33.33 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 
159 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.86 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.13 
 
 
158 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  32.38 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.76 
 
 
196 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
214 aa  52.4  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  32.38 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.48 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  31.36 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  36.46 
 
 
194 aa  52  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  36.46 
 
 
194 aa  52  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.1 
 
 
188 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 
212 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03462  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (icmt) family  42.5 
 
 
90 aa  51.6  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  30.97 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  30.91 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.29 
 
 
158 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.47 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  37.84 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41060  hypothetical protein  33.06 
 
 
153 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222653  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.2 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.25 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  44.59 
 
 
137 aa  48.5  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.59 
 
 
188 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.14 
 
 
157 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.71 
 
 
162 aa  48.5  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.27 
 
 
210 aa  48.5  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  32 
 
 
147 aa  48.1  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
226 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>