56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5015 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  490  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  52.72 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  52.72 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  52.14 
 
 		 252 aa  241  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6423  hypothetical protein  52.1 
 
 		 244 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3499  putative integral membrane protein  53.78 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3549  putative integral membrane protein  53.78 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.393882  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3486  putative integral membrane protein  53.78 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2947  putative integral membrane protein  50.85 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704391  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  53.39 
 
 		 245 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  47.7 
 
 		 252 aa  228  9e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13267  integral membrane protein  51.24 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.849706  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  48.95 
 
 		 279 aa  225  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  51.06 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4814  putative integral membrane protein  49.58 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  31.38 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.66 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  40.96 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  35.25 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  34.74 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2950  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.37 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  25.3 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  30.77 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0910  hypothetical protein  25.62 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3239  hypothetical protein  29.35 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303297  normal  0.187673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.8 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3864  hypothetical protein  37.65 
 
 		 174 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01050  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase, putative  28.07 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442432  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  28.21 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.2 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.15 
 
 		 189 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0193  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.92 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00375189  decreased coverage  0.000266905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  31.08 
 
 		 186 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  35.14 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.83 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.03 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.34 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.56 
 
 		 166 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  34.94 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.18 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.33 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  36.28 
 
 		 161 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 		 189 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 		 189 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 		 189 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0345  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase-like protein  32.29 
 
 		 126 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.7101  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.93 
 
 		 189 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  28.87 
 
 		 168 aa  42.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0145  hypothetical protein  30.1 
 
 		 197 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.93 
 
 		 189 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30 
 
 		 207 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  36.49 
 
 		 207 aa  42  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20970  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  32.26 
 
 		 184 aa  41.6  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>