33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13267 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13267  integral membrane protein  100 
 
 		 244 aa  487  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.849706  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3486  putative integral membrane protein  72.73 
 
 		 257 aa  328  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3549  putative integral membrane protein  72.73 
 
 		 257 aa  328  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.393882  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3499  putative integral membrane protein  72.73 
 
 		 257 aa  328  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2947  putative integral membrane protein  68.78 
 
 		 262 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704391  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  52.3 
 
 		 257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  52.3 
 
 		 257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  51.23 
 
 		 252 aa  261  6.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4814  putative integral membrane protein  50.42 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6423  hypothetical protein  58.82 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  52.12 
 
 		 279 aa  248  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  54.66 
 
 		 266 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  54.2 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  56.36 
 
 		 252 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  51.24 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  27.5 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  38.89 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  26.21 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0910  hypothetical protein  27.64 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  30.62 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3239  hypothetical protein  35.42 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303297  normal  0.187673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  30.11 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  43.48 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  45.07 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.03 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2950  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.48 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.52 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.97 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  32.88 
 
 		 196 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.62 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3864  hypothetical protein  38.75 
 
 		 174 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  31.82 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28 
 
 		 198 aa  42  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>