57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2806 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  521  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  55.69 
 
 
267 aa  258  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  54.18 
 
 
271 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  51.71 
 
 
274 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  51.94 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  49.81 
 
 
279 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  50.96 
 
 
269 aa  222  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  44.23 
 
 
258 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  41.15 
 
 
258 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  41.98 
 
 
277 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  40.23 
 
 
260 aa  159  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  42.8 
 
 
261 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  38.61 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  37.14 
 
 
277 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  36.16 
 
 
271 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  40.38 
 
 
253 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  36.54 
 
 
297 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  39.05 
 
 
267 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  37.7 
 
 
258 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  37.61 
 
 
264 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  39.8 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  32.46 
 
 
267 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  30.4 
 
 
261 aa  112  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  35.5 
 
 
256 aa  112  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  37.23 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  32.82 
 
 
258 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  37.45 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  34.1 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  34.43 
 
 
270 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  30.89 
 
 
261 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  38.58 
 
 
265 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  30.89 
 
 
261 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  31.64 
 
 
269 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  37.26 
 
 
256 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  34.18 
 
 
275 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  37.76 
 
 
265 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  36.7 
 
 
288 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  37.5 
 
 
262 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  38.98 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  34.35 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  31.2 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  34.4 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  33.87 
 
 
293 aa  89  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  34.2 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  34.2 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  35.23 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  31.48 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  35.29 
 
 
178 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  28.17 
 
 
397 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809933 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04556  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02670)  25.41 
 
 
359 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.114313  normal  0.885943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  30.73 
 
 
269 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  45 
 
 
488 aa  49.7  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  28.04 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  36 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0049  hypothetical protein  24.55 
 
 
230 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.976461  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1466  hypothetical protein  27.21 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  22.26 
 
 
311 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>