67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0131 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  78.91 
 
 
256 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  48.83 
 
 
271 aa  249  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  44.06 
 
 
267 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  40.23 
 
 
261 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  45.65 
 
 
264 aa  195  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  42.8 
 
 
263 aa  192  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  48.71 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  41.25 
 
 
267 aa  181  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  39.84 
 
 
264 aa  175  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  41.15 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  41.7 
 
 
253 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  41.9 
 
 
269 aa  166  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  38.74 
 
 
270 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  40.65 
 
 
293 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  46.07 
 
 
273 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  37.17 
 
 
260 aa  158  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  35.77 
 
 
264 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  38.74 
 
 
262 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  40.39 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  40 
 
 
256 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  35.74 
 
 
258 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  38.31 
 
 
275 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  38.93 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  38.31 
 
 
297 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  34.63 
 
 
277 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  36.69 
 
 
265 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  34.84 
 
 
269 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  35.71 
 
 
258 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  34.93 
 
 
279 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  36.71 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  37.75 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  32.73 
 
 
274 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  30.54 
 
 
289 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  37.6 
 
 
271 aa  125  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  35.34 
 
 
275 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  36.25 
 
 
261 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  36.25 
 
 
261 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  35.64 
 
 
288 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  37.84 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  33.81 
 
 
257 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  34.44 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  38.67 
 
 
178 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  29.5 
 
 
293 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  29.17 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  30.46 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  30.46 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0049  hypothetical protein  31.65 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.976461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  29.78 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  24.88 
 
 
397 aa  62.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  33.06 
 
 
269 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  30.73 
 
 
269 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  26 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  30.58 
 
 
304 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  32.5 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  30.1 
 
 
488 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48600  predicted protein  27.37 
 
 
451 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.18 
 
 
157 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.57 
 
 
157 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.56 
 
 
162 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10451  transmembrane protein  40.82 
 
 
62 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.28 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45361  predicted protein  27.38 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  27.63 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  23.08 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.14 
 
 
157 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>