64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2323 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  78.91 
 
 		 258 aa  400  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  51.94 
 
 		 271 aa  255  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  45.28 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  41.25 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  44.27 
 
 		 263 aa  195  6e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  46.09 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  42.19 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  46.98 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  41.86 
 
 		 267 aa  178  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  43.53 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  42.91 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  41.49 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  41.22 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  38.55 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  46.45 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  42.11 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  40.16 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  39.18 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  41.37 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  41.04 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  41.63 
 
 		 262 aa  148  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  37.31 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  38.96 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  39.68 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  36.05 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  38.64 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  35.74 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  37.02 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  39.58 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  32.27 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  36.64 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  35.86 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  38.62 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  35.86 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  35.47 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  34.52 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  33.71 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  41.94 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  37.35 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  34.12 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  34.43 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  33.5 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  39.38 
 
 		 178 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  32.81 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  33.91 
 
 		 273 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  33.91 
 
 		 273 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  30 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  25.12 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0049  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.976461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  31.36 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  27.72 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  25.55 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45361  predicted protein  30.18 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  27.97 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  28.93 
 
 		 304 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10451  transmembrane protein  50 
 
 		 62 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  28.35 
 
 		 488 aa  48.9  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  23.53 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  31.76 
 
 		 166 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48600  predicted protein  29.5 
 
 		 451 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.17 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.15 
 
 		 162 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 157 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>