40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10452 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  100 
 
 		 178 aa  346  8e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  54.75 
 
 		 267 aa  184  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  56.67 
 
 		 264 aa  165  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  48.02 
 
 		 267 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  47.74 
 
 		 264 aa  137  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  43.65 
 
 		 260 aa  117  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  44.71 
 
 		 293 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  44.83 
 
 		 270 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  44.83 
 
 		 275 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  43.33 
 
 		 264 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  41.76 
 
 		 263 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  41.77 
 
 		 265 aa  98.2  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  38.67 
 
 		 258 aa  97.1  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  38.67 
 
 		 261 aa  94  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  35.56 
 
 		 271 aa  88.2  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  37.2 
 
 		 258 aa  87.8  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  34.78 
 
 		 256 aa  85.9  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  40.99 
 
 		 256 aa  85.1  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  37.02 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  37.75 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  37.5 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  33.54 
 
 		 269 aa  77.8  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  34.64 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  30.29 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  31.79 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  33.73 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  31.79 
 
 		 275 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  28.9 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  29.67 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  32.26 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  30.77 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  31.25 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  32.77 
 
 		 277 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  35.33 
 
 		 297 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  32 
 
 		 260 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  35.67 
 
 		 261 aa  52.4  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  40.2 
 
 		 273 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  25.9 
 
 		 288 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  31.76 
 
 		 277 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>