56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4486 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  89.18 
 
 		 274 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  80.6 
 
 		 275 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  73.06 
 
 		 271 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  51.52 
 
 		 267 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  50.19 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  49.41 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  39.93 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  39.61 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  37.64 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  38.35 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  38.4 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  33.81 
 
 		 271 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  41.18 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  36.26 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  34.93 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  35.5 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  30.83 
 
 		 261 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  32.39 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  33.59 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  36.64 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  35.63 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  33.96 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  37.13 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  33.82 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  30.77 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  35.16 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  32.97 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  34.56 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  31.9 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  33.08 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  34.6 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  33.33 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  30.17 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  31.31 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  31.9 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  33.07 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  30.39 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  30.22 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  31.94 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  29.58 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  28.77 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  36.94 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  28.49 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  36.94 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  36.94 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  26.92 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0049  hypothetical protein  26.45 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.976461  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  41.43 
 
 		 488 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  24.14 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  43.33 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  29.29 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  25.98 
 
 		 208 aa  45.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  27.75 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>