62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3566 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  531  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  47.88 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  48.15 
 
 
253 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  45.42 
 
 
265 aa  175  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  44 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  46.22 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  43.09 
 
 
275 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  46.7 
 
 
258 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  43.39 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  40.77 
 
 
271 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  42.34 
 
 
262 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  42.31 
 
 
267 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  42.45 
 
 
258 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  40.31 
 
 
256 aa  156  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  35.41 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  47.92 
 
 
256 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  42.86 
 
 
264 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  40.51 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  41.37 
 
 
265 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  38.34 
 
 
269 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  39.75 
 
 
293 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  39.16 
 
 
270 aa  141  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  31.95 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  38.62 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  34.3 
 
 
264 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  37.7 
 
 
258 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  38.08 
 
 
277 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  37.25 
 
 
267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  35.21 
 
 
257 aa  106  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  34.75 
 
 
269 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  37.22 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  35.6 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  34.36 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  33.76 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  36.25 
 
 
277 aa  95.9  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  31.41 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  32.57 
 
 
296 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  32.12 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  33.46 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  33.46 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  32.34 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  30.53 
 
 
279 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  28.46 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  31.67 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  32.08 
 
 
261 aa  89  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  32.05 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  32.34 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  30.16 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  26.29 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  29.27 
 
 
208 aa  62.8  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04556  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02670)  26.78 
 
 
359 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.114313  normal  0.885943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  30.46 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  26.76 
 
 
397 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  36.89 
 
 
178 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  24.21 
 
 
311 aa  52.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45361  predicted protein  33.85 
 
 
331 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10451  transmembrane protein  52.94 
 
 
62 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  34.29 
 
 
488 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15223  predicted protein  26.76 
 
 
313 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  20.51 
 
 
212 aa  45.8  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2218  protein of unknown function DUF1295  24.46 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  0.0389914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>