44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3389 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  62.41 
 
 		 269 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  61.89 
 
 		 269 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  60.61 
 
 		 269 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  30.6 
 
 		 488 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48600  predicted protein  30.28 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  30.61 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  32.26 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  28.76 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45361  predicted protein  27.59 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  36.75 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  33.18 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  38.33 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  29.81 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  31.35 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  29.41 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  28.81 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  30.2 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  28 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  27.64 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  35.86 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  25.62 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  27.2 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  35.57 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  27.18 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  25.93 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  30.25 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  30.11 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  28.43 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  29.17 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  26.42 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  28.5 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  28.14 
 
 		 258 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  28.5 
 
 		 261 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  27.08 
 
 		 261 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  29.41 
 
 		 264 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  32.41 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  26.34 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  34.21 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  33.94 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  33.04 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  27.16 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  27.18 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  34.23 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.613373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>