63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4267 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  100 
 
 
275 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  52.74 
 
 
264 aa  244  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  49.8 
 
 
270 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  45.66 
 
 
267 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  50.81 
 
 
267 aa  225  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  50.2 
 
 
293 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  43.68 
 
 
264 aa  195  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  43.96 
 
 
264 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  46.15 
 
 
265 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  42.97 
 
 
260 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  42.26 
 
 
256 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  39.69 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  39.92 
 
 
261 aa  169  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  44.07 
 
 
269 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  42.97 
 
 
262 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  42.37 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  38.29 
 
 
297 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  41.57 
 
 
273 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  37.55 
 
 
258 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  36.26 
 
 
271 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  37.02 
 
 
263 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  38.28 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  40.54 
 
 
265 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  38.78 
 
 
256 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  35.52 
 
 
258 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  36.74 
 
 
258 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  36.53 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  36.6 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  33.21 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  42.86 
 
 
178 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  32.46 
 
 
269 aa  109  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  31.54 
 
 
275 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  34.54 
 
 
277 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  29.44 
 
 
289 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  31.09 
 
 
274 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  30.17 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  34.78 
 
 
271 aa  95.5  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  32.81 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  30.53 
 
 
293 aa  92.8  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  29.32 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  31.34 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  35.23 
 
 
261 aa  87  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  34.66 
 
 
273 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  34.66 
 
 
273 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  32.97 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  30.88 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  28.65 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  27.07 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  25.47 
 
 
269 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  29.75 
 
 
208 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  28.68 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  27.64 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  33.33 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  24.35 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10451  transmembrane protein  50 
 
 
62 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  27.59 
 
 
488 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  38.46 
 
 
166 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  25 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0049  hypothetical protein  24.79 
 
 
230 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.976461  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04556  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02670)  24.31 
 
 
359 aa  43.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.114313  normal  0.885943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  30.61 
 
 
147 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  22.07 
 
 
212 aa  42.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  26.92 
 
 
157 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>