55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4841 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  56.11 
 
 		 269 aa  289  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  52.81 
 
 		 275 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  52.81 
 
 		 274 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  51.52 
 
 		 279 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  54.94 
 
 		 271 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  56.4 
 
 		 271 aa  251  7e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  44.15 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  39.15 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  43.07 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  37.97 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  38.11 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  41.43 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  42.41 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  38.06 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  40.34 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  35.88 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  38.17 
 
 		 256 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  33.7 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  38.84 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  37.55 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  37.04 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  36.57 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  36.74 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  30.94 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  30.51 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  37.12 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  36.9 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  41.9 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  35.82 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  28.24 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  29.23 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  32.97 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  27.84 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  33.07 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  36.72 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  34.58 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  36.49 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  36.07 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  27.53 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  35.27 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  31.11 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  36.32 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  32.56 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  32.21 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  32.21 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  32.21 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  25.63 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  43.48 
 
 		 488 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  26.61 
 
 		 397 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  23.45 
 
 		 311 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  40 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0049  hypothetical protein  26.83 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.976461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  41.82 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.672197 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04556  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02670)  28.89 
 
 		 359 aa  42  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.114313  normal  0.885943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>