60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3586 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  100 
 
 
264 aa  515  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  63.46 
 
 
267 aa  340  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  48.43 
 
 
267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  50.64 
 
 
264 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  50.56 
 
 
260 aa  225  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  48.13 
 
 
293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  47.53 
 
 
270 aa  214  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  45.04 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  45.02 
 
 
264 aa  188  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  56.67 
 
 
178 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  39.13 
 
 
261 aa  170  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  40.34 
 
 
265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  40.39 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  36.02 
 
 
258 aa  159  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  39.27 
 
 
256 aa  158  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  38.55 
 
 
256 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  33.73 
 
 
269 aa  152  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  38.82 
 
 
263 aa  149  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  37.39 
 
 
258 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  33.07 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  44.09 
 
 
273 aa  135  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  36.75 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  38.74 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  29.8 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  35.22 
 
 
297 aa  122  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  34.78 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  37.6 
 
 
265 aa  119  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  34.35 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  31.65 
 
 
277 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  33.08 
 
 
279 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  32.43 
 
 
274 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  33.6 
 
 
271 aa  102  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  30.42 
 
 
275 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  29.77 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  33.49 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  31.91 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  32.14 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  33.66 
 
 
293 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  31.08 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  32.28 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  26.56 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  31.2 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  31.2 
 
 
273 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  31.2 
 
 
273 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  29.29 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  28.75 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10451  transmembrane protein  53.23 
 
 
62 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  31.82 
 
 
304 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  26.72 
 
 
264 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  23.62 
 
 
488 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  27.31 
 
 
397 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  27.78 
 
 
208 aa  49.3  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  28.33 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  28.99 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  31.71 
 
 
269 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  21.11 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.87 
 
 
188 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.7 
 
 
202 aa  43.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48600  predicted protein  24.06 
 
 
451 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>